scholarly journals Taxonomic characteristics of micro-organisms isolated from the Baikal seal

2021 ◽  
Vol 6 (1) ◽  
pp. 42-49
Author(s):  
A. A. Pliska

The relevance of the ecological problem of the mass death of the Baikal seal (Pusa sibirica Gm.) forces researchers to establish causes of this phenomenon. The article presents the results of microbiological studies of swabs isolated from the nasal, oral cavities and rectum. The taxonomic characteristics of microorganisms and their virulence were studied. 14 Baikal seals found in the nerpinaria of Listvyanka were tudied. It was established that in the seal there are the following microorganisms: Clostridium perfringens, Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Staphylococcus warneri, Pseudomona aeruginosa, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Proteus hauseri, Proteus vulgaris bellisella, Proteus migarisella, rabitemorganii, Psychrobactersanguinis, Enterobacter cloacae. When studying the virulence of microorganisms, it was found that 58% of the strains do not cause the death of laboratory animals, they are mainly the representatives of opportunistic microflora. 42% of the strain were pathogenic, of which two strains of Plesi omonas shigelloides and 42 strains of Clostridium perfringens were identified.

2014 ◽  
Vol 8 (4) ◽  
pp. 27-33
Author(s):  
E. J. AL-Kalifawi

The study was conducted from January to March 2012. In this study colorimetric VITEK-2 Compact system used for its accuracy and rapidity to identify isolates and to detect several antimicrobial resistances.The study also investigate the antibacterial effect of Kombucha tea on isolated bacteria from diabetic foot ulcer. The bacteria isolated were eight gram negative bacteria, namely, Acinetobacter baumannii 3 (2%), Enterobacter cloacae 5 (4%), Escherichia coli 13 (10%), Klebsiella pneumoniae 7 (6%), Citrobacter spp. 4 (3%), Proteus mirabilis 3 (2%), Proteus vulgaris 3 (2%) and Pseudomonas aeruginosa 44 (35%). Four gram positive bacterium, Enterococcus faecalis 6 (5%), Staphylococcus aureus 17 (13%), Staphylococcus epidermidis 13 (10%) and Streptococcus spp. 9 (8%). The antimicrobial activities of antibiotics showed that, all isolates are sensitive to Ciprofloxacin, Levofloxacin and Ofloxacin. The resistance to other types of antimicrobial differ with different isolate. The effect of Kombucha tea on all isolates wasclear at 7days of incubation; the diameter of inhibition was 6mm for Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris and Enterococcus faecalis. 7mm for Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter spp., Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp. 8mm for Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. The maximum activity of fermented tea was recorded at 14days incubation of Kombucha organism against all isolates, the diameter of inhibition was 21mm for Acinetobacter baumannii, 24mm for Enterobacter cloacae, 23mm for Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp., 16mm for Klebsiella pneumoniae, 22mm for Citrobacter spp. and Enterococcus faecalis, 25mm for Proteus mirabilis and Staphylococcus aureus, 20mm for Proteus vulgaris, 26mm for Pseudomonas aeruginosa. The antibacterial activity of Kombucha tea decrease with increase incubation periods28 days.


2020 ◽  
Vol 5 (4) ◽  
pp. 364-373
Author(s):  
Anna A. Pliska ◽  

The results of microbiological studies of the material taken from the diseased seal are presented. The taxonomic characteristics of microorganisms, their virulence and antibiotic resistance were studied. Treatment measures were developed and performed. It was found that the seal has the following types of microorganisms: Staphylococcus aureus; Enterococcus faecalis; Escherichia coli; Staphylococcus warneri; Proteus vulgaris; Clostridium perfringens, Proteushauseri, Staphylococcus epidermidis, Plesiomonas shigel-loides. All pathogens isolated from the seals were sensitive to 60.3% of antibiotics (ampicillin, cefuroxime, cefixime, gentamicin, amikacin, ciprofloxacin, ofloxacin, furadonin, Ceftriaxone, vancomycin) and resistant to 39.7% of antibiotics, two representatives of cephalosporins (cefaclor and ceftazidim) and ticarcillin.


2018 ◽  
Vol 20 (92) ◽  
pp. 13-17
Author(s):  
Ya. V. Kisera ◽  
L. Ya. Bozhyk ◽  
Yu. G. Storchak

The importance of the influence of microorganisms on the health of humans and animals is beyond doubt. In recent decades, a large amount of data on the interaction of the flora with the elements of the immune system has been accumulated. Therefore, it is important to identify any hazardous factors that must be prevented or neutralized. One of such factors is the circulating flora of the premises, the organism of the animal, its virulence and resistance to antibacterial drugs. Bacteriological studies included bacteriological culture on the nutrient environment, their identification and the study of antibioticsensitivity. According to the results of bacteriological studies of milk samples, it was found that in 25% of the studied samples Staphylococcus aureus cultures were found in different concentrations. In 4 samples, Proteus vulgaris was detected. Bacteriological studies of vaginal exudate from the cows after calving have shown that they have Escherichia coli, Escherichia coli haemolitica, Staphylococcus aureus, Streptococcus haemolyticus, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter cloacae, Proteus vulgaris, mold fungi of the Aspergillus spp. The studies of the exudate from the nasal passages and the mouthof the calves found that all the tested samples contained Escherichia coli, Proteus vulgaris, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus spp., Klebsiella pnemoniae and Aspergillus and Candida fungi. The results of calf excrement studies revealed the presence of a number of microorganisms: Escherichia coli, Escherichia coli haemolitica, Proteus vulgaris, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter cloacae and Enterobacter faecalis in different percentages. In determining the sensitivity of isolated cultures to antibacterial drugs, it has been established that Staphylococcus aureus cultures are sensitive to all antibiotics; Proteus vulgaris show resistance to ampicillin, amoxicillin; Escherichia coli haemolytica is resistant to ampicillin.


2017 ◽  
Vol 1 (2) ◽  
pp. 48-60
Author(s):  
A.G. Salmanov ◽  
A.V. Rudenko

Мета роботи — вивчити резистентність до антибіотиків бактеріальних збудників інфекцій сечових шляхів (ІСШ), виділених у пацієнтів урологічного стаціонару в м. Києві. Матеріали і методи. Досліджено 1612 штамів бактерій, виділених із сечі хворих з ІСШ (цистит, уретрит, пієлонефрит), госпіталізованих в урологічне відділення ДУ «Інститут урології НАМН України» у м. Києві протягом 2016 р. Серед пацієнтів переважали жінки — 1201 (74,5 %). Вік хворих становив від 17 до 74 років. Для збору даних використано медичну документацію лікарні. Мікробіологічні дослідження виконано у лабораторії мікробіології ДУ «Інститут урології НАМН України». Аналізували результати культурального дослідження зразків сечі, зібраних за наявності клінічних ознак ІСШ. Дослідження клінічного матеріалу та інтерпретацію отриманих результатів проводили загальноприйнятими методами. Вивчено чутливість уропатогенів до 31 антибіотика дискодифузійним методом відповідно до рекомендацій Інституту клінічних та лабораторних стандартів США (Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)). Результати та обговорення. Аналіз мікробного спектра сечі виявив домінування серед уропатогенів штамів Escherichia coli (32,0 %), Enterococcus faecalis (19,5 %), Klebsiella pneumoniae (10,9 %), Staphylococcus epidermidis (8,9 %), S. haemolyticus (6,5 %) та Pseudomonas aeruginosa (6,4 %). Частка Enterococcus faecium, Enterobacter aerogenes і Streptococcus viridans становила відповідно 2,5, 2,2 і 1,6 %, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris та Providencia rettgeri — менше 1,0 %. У більшості випадків (69,7 %) мікроорганізми виділено у монокультурі, у решті випадків — у мікробних асоціа- ціях. Високу резистентність до тестованих антибіотиків виявили штами E. aerogenes (45,1 %), E. cloacae (45,7 %), E. faecium (40,9 %), E. faecalis (40,7 %), E. coli (39,9 %), P. aeruginosa (34,0 %), K. pneumoniae (28,6 %). Найбільш активними до уропатогенів були іміпенем (E. coli — 87,6 %, P. aeruginosa — 75,7 %, E. cloacae — 67,3 %, E. aerogenes — 72,6 %, K. pneumoniae — 93,2 %), меропенем (E. coli — 89,1 %, P. aeruginosa — 76,7 %, K. pneumoniae — 82,6 %), лефлоцин (E. coli — 74,5 %, ентерококи — 78,7 %, P. aeruginosa — 76,7 %, E. cloacae — 73,9 %, E. aerogenes — 80,4 %, K. pneumoniae — 83,5 %), амоксицилін/клавуланат (ентерококи — 84,6 %), фурагін (ентерококи — 82,6 %), цефоперазон (K. pneumoniae — 89,2 %, P. aeruginosa — 73,8 %), цефтріаксон (K. pneumoniae — 80,1 %). Висновки. Антибіотикорезистентність збудників ІСШ — важлива терапевтична проблема. Найбільшою активністю до уропатогенів характеризуються іміпенем, меропенем, лефлоцин, амоксицилін/ клавуланат, фурагін, цефоперазон, цефтріаксон, які можна розглядати як препарат вибору для призначення стартової терапії ІСШ. Необхідно здійснювати постійний моніторинг за резистентністю до дії антибіотиків. Політику використання антибіотиків у кожному стаціонарі слід визначати залежно від локальних даних щодо резистентності до протимікробних препаратів.


2020 ◽  
Vol 3 (2) ◽  
pp. 96
Author(s):  
Isna Romadhona ◽  
Fauna Herawati ◽  
Rika Yulia

Antibiotik merupakan obat yang digunakan untuk mengatasi dan mencegah infeksi bakteri. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat dapat menimbulkan berbagai masalah, diantaranya pengobatan akan lebih mahal dan juga risiko terjadinya resistensi bakteri terhadap antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil penggunaan antibiotik dan profil peta kuman pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik serta untuk mengetahui kesesuaian penggunaan antibiotik dengan mengacu pada Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/XII/2011. Data penggunaan antibiotik diperoleh dari catatan Rekam Medis pada periode Januari – November 2017. Data penggunaan antibiotik dihitung dengan menggunakan rumus DDD/100 pasien-hari rawat. Hasil perhitungan DDD/100 pasien-hari rawat menunjukkan hasil sebesar 470,11 DDD/100 pasien-hari rawat. Peta kuman pada pasien gangren, melaporkan adanya bakteri Enterobacter cloacae 24%, Escherichia coli 18%, Staphylococcus aureus 15%, Acinetobacter baumannii 9%, Pseudomonas aeruginosa 6%, Citrobacter youngae 6%, Enterobacter aerogenes 6%, Proteus vulgaris 6%, Staphylococcus schleiferi 6%, Klebsiella pneumoniae 3%, dan Proteus mirabilis 3% . Penggunaan antibiotik seftriakson dan metronidazol pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik pada periode Januari – November 2017 telah sesuai dengan pedoman penggunaan antibiotik berdasarkan Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/ XII/2011, yaitu antibiotik golongan sefalosporin generasi III yang lebih aktif terhadap Enterobacteriaceae dan antibiotik golongan nitroimidazol yang dapat mengobati infeksi bakteri basil anerob Gram-Negatif.


2019 ◽  
Vol 10 (2) ◽  
pp. 152
Author(s):  
Herman Herman ◽  
Rahman Rahman ◽  
Hari Asti

Deteksi dini sepsis sangat penting karena sepsis memiliki angka mortalitas dan morbiditas sangat tinggi. Kultur darah dan prokalsitonin adalah pemeriksaan untuk mendeteksi sepsis di RSUP DR Wahidin Sudirohusodo tetapi biasanya hasil prokalsitonin tidak sesuai dengan hasil kultur darah. Tujuan penelitian ini untuk menganalisis prokalsitonin dan kultur darah sebagai penanda sepsis di RSUP DR Wahidin Sudirohusodo Makassar. Ini adalah penelitian observasi laboratorik yang bersifat deskriptif dengan teknik consequtive sampling. Berdasarakan penelitian ini didapatkan hasil kultur darah berupa bakteri aerob, seperti Staphylococcus hominis ssp hominis, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae ssp pneumoniae, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Burkholderia cepacia, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter aerogenes, Burkholderia pseudomallei, Acinetobacter baumannii, Aermonas hydrophila, dan Enterobacter cloacae complex serta disimpulkan pula Prokalsitonin memiliki sensitivitas 100 % ,spesifisitas 65 %, akurasi 24 %. Pada penelitian yang dilakukan menunjukkan bahwa Prokalsitonin memiliki sensitivitas yang sangat tinggi namun proklasitonin memiliki spesifitas dan akurasi yang rendah sebagai penanda sepsis di RSUP DR Wahidin Sudirohusodo Makassar.Kata kunci : Kultur Darah, Prokalsitonin, RSUP DR Wahidin Sudirohusodo Makassar, Sepsis


2015 ◽  
Vol 12 (3) ◽  
pp. 459-467
Author(s):  
Baghdad Science Journal

The leaves and stems of the local Purslane plant ( Portulaca oleracea oleracea L. ) were used to preapare the extract of two types ( wet and dried extractions) the extracts were prepared by weighting of 60grams of the wet and the dried plant individually, then boiled in 500ml of distal water. Finally the volume was completed to1 liter, then we used these extracts to prepare of 8 types of the culture media contained basic, selective and enrichment media for growing a group of pathogenic bacteria. 8 types of bacteria were used for this purpose: Escherichia coli, Pseudomonas flouresence, Staphylococcus aureus , Staphylococcus epidermidis, Bacillus subtilis , Klebsiella pneumoniae , Proteus mirabilis and Proteus vulgaris. The stastical analysis of the results showed that the locally prepared culture media in this research (Nutrient wet portulaca agar , Blood - wet portulaca agar, Manitol- wet portulaca agar, Lactose- wet portulaca agar, Nutrient dried portulaca agar , Blood - dried portulaca agar , Manitol- dried portulaca agar and Lactose- dried portulaca agar) were suitable for culturing of these pathogenic bacteria when compared to the media that supplied by Oxoid company. In addition they also revealed good growth and they were sufficient to use as basic, enriched and selective media .


2020 ◽  
Vol 10 (2) ◽  
pp. 62-78
Author(s):  
Heysell Dodanig Delgado Silva ◽  
Leandro Alberto Páramo Aguilera

En la producción quesera artesanal de Nicaragua coexisten un sin número de microorganismos que no han sido estudiados, y muchas veces no se considera como intervienen en la producción del queso. Por tal razón, en este trabajo se aislaron microorganismos de una quesera artesanal en medios de cultivos básicos AN, LB, PCA, PDA y AM con el objeto de aislar una amplia cantidad de microorganismos. Una vez aislados y purificados los cultivos se obtuvieron 82 bacterias, 3 hongos levaduriformes y 12 hongos filamentosos. Mediante el análisis morfológico de las características macro y microscópicas se seleccionaron 16 morfotipos que incluían bacterias y hongos, para la identificación molecular mediante la extracción del ADN, la amplificación por la PCR y la secuenciación de las regiones 16S para bacterias, ITS para hongos filamentosos y los dominios D1/D2/D3 para las levaduras. Se logró identificar 20 aislados a nivel de especie: Bacillus cereus (1), Enterobacter cloacae (1), Escherichia coli (1), Klebsiella pneumoniae (2), Planococcus maritimus (1), Proteus vulgaris (1), Pseudomonas aeruginosa (2), Psychrobacter alimentarius (1), Serratia marcescens (3), Staphylococcus aureus (1), Cybelindnera jadinii (2), Rhodotorula mucilaginosa (1), Candida pararugosa (1), Aspergillus hiratsukae (1) y Trichoderma orientale (1). Además, se identificaron 7 bacterias a nivel de género: Enterobacter sp (4), Escherichia sp (1), Klebsiella pneumoniae (1) y Pseudomonas sp (1). La presente investigación contribuirá al avance del conocimiento de los microorganismos presentes en el proceso de producción de una quesera artesanal, permitiendo la selección y utilización de estos para su aplicación en procesos biotecnológicos.


2021 ◽  
Vol 31 (7) ◽  
pp. 86-90
Author(s):  
Žaneta Maželienė ◽  
Gintarė Lingytė ◽  
Evelina Dailidaitė ◽  
Ingrida Viliušienė

Įvadas. Pasaulio sveikatos organizacijos (PSO) duomenimis, bakterijų atsparumas antibiotikams kelia didelę grėsmę visame pasaulyje ir sunkina infekcinių ligų gydymą [1]. Manoma, kad apie 70 proc. bakterijų, kurios sukelia infekcinius susirgimus ligoninėse, yra atsparios bent vienam iš gydymui naudojamų antibiotikų. Ši situacija skatina ieškoti kitų sprendimų, vienas iš jų – bičių produktus naudoti kaip natūralius antibiotikus dėl jų antimikrobinio veikimo. Tyrimo tikslas – nustatyti skirtingose Lietuvos vietovėse surinktų žiedadulkių ekstraktų antimikrobinį veikimą. Tyrimo metodika. Atliktas įvairiuose Lietuvos ūkiuose surinktų žiedadulkių skirtingos koncentracijos ekstraktų mikrobiologinis tyrimas. Nustatytas 50 žiedadulkių ekstraktų mėginių antimikrobinis poveikis dešimties etaloninių bakterijų kultūrų ir grybelio Candida albicans atžvilgiu. Tyrimo duomenų analizė atlikta naudojant aprašomąją statistiką, skaičiuojant dažnius bei grupių palyginimą pagal Kruskal Wallis, tyrimo duomenys apdoroti Microsoft Excel 2019 programa. Tyrimo rezultatai. Nustatyta, kad stipriausią antimikrobinį poveikį turėjo D žiedadulkių, surinktų Kaišiadorių rajone, ekstraktas. D ekstrakto antimikrobinis poveikis Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus cereus, Listeria monocytogenes atžvilgiu nustatytas esant 0,025 ml ekstrakto 1 agaro ml. Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumoniae, Proteus vulgaris ir grybelį Candida albicans, išskyrus Escherichia coli, ekstraktas veikė esant jo 0,0375 – 0,05 ml agaro 1 ml. Žiedadulkių ekstraktas gramteigiamąsias bakterijas veikia stipriau, lyginant su gramneigiamosiomis. Šis skirtumas siejamas su gramteigiamų ir gramneigiamų bakterijų ląstelės sienelės struktūros skirtumais. Išvados. Stipriausią antimikrobinį veikimą turi žiedadulkės, surinktos Kaišiadorių rajone. Nustatyta, kad žiedadulkių ekstraktai stipriau veikia gramteigiamąsias bakterijas, lyginant su gramneigiamosiomis.


2015 ◽  
Vol 17 (4 suppl 3) ◽  
pp. 1142-1149 ◽  
Author(s):  
J.A.L MIRANDA ◽  
J.A. ROCHA ◽  
K.M. ARAÚJO ◽  
P.V. QUELEMES ◽  
S.J. MAYO ◽  
...  

RESUMO O uso de plantas medicinais no tratamento de doenças é uma estratégia antiga utilizada por praticamente todas as populações do mundo, e, embora novos antibióticos tenham sido desenvolvidos para o controle de micro-organismos infecciosos, às vezes são ineficazes. Diversos extratos de plantas medicinais têm efeitos antimicrobianos, principalmente quando associados à antibióticos de uso clínico, representando alternativa terapêutica para doenças infecciosas. Montrichardia linifera, conhecida popularmente como aninga, é espécie macrófita, aquática emergente de hábito herbáceo, pertencente a família Araceae e ocorre em áreas alagáveis. A utilidade farmacológica desta espécie é diversificada tendo sido relatada como cicatrizante, antirreumático, antidiurético e expectorante. Devido à relevância no campo etnofarmacológico, ampla utilização na medicina popular e escassez de trabalhos relacionados à atividade antibacteriana desta espécie, objetivou-se com este trabalho avaliar a atividade antibacteriana de extratos alcoólicos de folhas de Montrichardia linifera, coletadas na margem do rio Igaraçu, Parnaíba-PI. O extrato foi testado em oito cepas de bactérias: Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa. Foram utilizadas as técnicas de verificação da formação de halos de inibição e determinação das concentrações inibitórias e bactericidas mínimas. Os testes antibacterianos evidenciaram como principais resultados que o extrato metanólico seco (EMS), extrato metanólico fresco (EMF), e o extrato etanólico seco (EES), apresentaram ação antibacteriana, enquanto o extrato etanólico fresco (EEF) não apresentou atividade para as bactérias testadas. O EMS foi o mais eficiente, inibindo o crescimento bacteriano na concentração de 200 μg/mL para E. faecalis, 400 μg/mL para S. aureus, 400 μg/mL para S. epidermidis e 2.000 μg/mL para P. aeruginosa. O EMF obteve CIM de 2.000 μg/mL para E. faecalis e EES obteve CIM de 250 μg/mL para E. faecalis. Os resultados demonstraram que M. linifera constitui fonte eficiente de compostos bioativos antibacterianos. Os estudos sobre as propriedades farmacológicas de plantas da família Araceae são escassos, e os resultados deste trabalho são pioneiros em relação a atividade antibacteriana desta espécie.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document