Identificación molecular de microorganismos aislados de quesera artesanal ubicada en la Libertad-Chontales, Nicaragua

2020 ◽  
Vol 10 (2) ◽  
pp. 62-78
Author(s):  
Heysell Dodanig Delgado Silva ◽  
Leandro Alberto Páramo Aguilera

En la producción quesera artesanal de Nicaragua coexisten un sin número de microorganismos que no han sido estudiados, y muchas veces no se considera como intervienen en la producción del queso. Por tal razón, en este trabajo se aislaron microorganismos de una quesera artesanal en medios de cultivos básicos AN, LB, PCA, PDA y AM con el objeto de aislar una amplia cantidad de microorganismos. Una vez aislados y purificados los cultivos se obtuvieron 82 bacterias, 3 hongos levaduriformes y 12 hongos filamentosos. Mediante el análisis morfológico de las características macro y microscópicas se seleccionaron 16 morfotipos que incluían bacterias y hongos, para la identificación molecular mediante la extracción del ADN, la amplificación por la PCR y la secuenciación de las regiones 16S para bacterias, ITS para hongos filamentosos y los dominios D1/D2/D3 para las levaduras. Se logró identificar 20 aislados a nivel de especie: Bacillus cereus (1), Enterobacter cloacae (1), Escherichia coli (1), Klebsiella pneumoniae (2), Planococcus maritimus (1), Proteus vulgaris (1), Pseudomonas aeruginosa (2), Psychrobacter alimentarius (1), Serratia marcescens (3), Staphylococcus aureus (1), Cybelindnera jadinii (2), Rhodotorula mucilaginosa (1), Candida pararugosa (1), Aspergillus hiratsukae (1) y Trichoderma orientale (1). Además, se identificaron 7 bacterias a nivel de género: Enterobacter sp (4), Escherichia sp (1), Klebsiella pneumoniae (1) y Pseudomonas sp (1). La presente investigación contribuirá al avance del conocimiento de los microorganismos presentes en el proceso de producción de una quesera artesanal, permitiendo la selección y utilización de estos para su aplicación en procesos biotecnológicos.

2020 ◽  
Vol 3 (2) ◽  
pp. 96
Author(s):  
Isna Romadhona ◽  
Fauna Herawati ◽  
Rika Yulia

Antibiotik merupakan obat yang digunakan untuk mengatasi dan mencegah infeksi bakteri. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat dapat menimbulkan berbagai masalah, diantaranya pengobatan akan lebih mahal dan juga risiko terjadinya resistensi bakteri terhadap antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil penggunaan antibiotik dan profil peta kuman pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik serta untuk mengetahui kesesuaian penggunaan antibiotik dengan mengacu pada Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/XII/2011. Data penggunaan antibiotik diperoleh dari catatan Rekam Medis pada periode Januari – November 2017. Data penggunaan antibiotik dihitung dengan menggunakan rumus DDD/100 pasien-hari rawat. Hasil perhitungan DDD/100 pasien-hari rawat menunjukkan hasil sebesar 470,11 DDD/100 pasien-hari rawat. Peta kuman pada pasien gangren, melaporkan adanya bakteri Enterobacter cloacae 24%, Escherichia coli 18%, Staphylococcus aureus 15%, Acinetobacter baumannii 9%, Pseudomonas aeruginosa 6%, Citrobacter youngae 6%, Enterobacter aerogenes 6%, Proteus vulgaris 6%, Staphylococcus schleiferi 6%, Klebsiella pneumoniae 3%, dan Proteus mirabilis 3% . Penggunaan antibiotik seftriakson dan metronidazol pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik pada periode Januari – November 2017 telah sesuai dengan pedoman penggunaan antibiotik berdasarkan Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/ XII/2011, yaitu antibiotik golongan sefalosporin generasi III yang lebih aktif terhadap Enterobacteriaceae dan antibiotik golongan nitroimidazol yang dapat mengobati infeksi bakteri basil anerob Gram-Negatif.


2014 ◽  
Vol 8 (4) ◽  
pp. 27-33
Author(s):  
E. J. AL-Kalifawi

The study was conducted from January to March 2012. In this study colorimetric VITEK-2 Compact system used for its accuracy and rapidity to identify isolates and to detect several antimicrobial resistances.The study also investigate the antibacterial effect of Kombucha tea on isolated bacteria from diabetic foot ulcer. The bacteria isolated were eight gram negative bacteria, namely, Acinetobacter baumannii 3 (2%), Enterobacter cloacae 5 (4%), Escherichia coli 13 (10%), Klebsiella pneumoniae 7 (6%), Citrobacter spp. 4 (3%), Proteus mirabilis 3 (2%), Proteus vulgaris 3 (2%) and Pseudomonas aeruginosa 44 (35%). Four gram positive bacterium, Enterococcus faecalis 6 (5%), Staphylococcus aureus 17 (13%), Staphylococcus epidermidis 13 (10%) and Streptococcus spp. 9 (8%). The antimicrobial activities of antibiotics showed that, all isolates are sensitive to Ciprofloxacin, Levofloxacin and Ofloxacin. The resistance to other types of antimicrobial differ with different isolate. The effect of Kombucha tea on all isolates wasclear at 7days of incubation; the diameter of inhibition was 6mm for Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris and Enterococcus faecalis. 7mm for Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter spp., Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp. 8mm for Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. The maximum activity of fermented tea was recorded at 14days incubation of Kombucha organism against all isolates, the diameter of inhibition was 21mm for Acinetobacter baumannii, 24mm for Enterobacter cloacae, 23mm for Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp., 16mm for Klebsiella pneumoniae, 22mm for Citrobacter spp. and Enterococcus faecalis, 25mm for Proteus mirabilis and Staphylococcus aureus, 20mm for Proteus vulgaris, 26mm for Pseudomonas aeruginosa. The antibacterial activity of Kombucha tea decrease with increase incubation periods28 days.


2017 ◽  
Vol 1 (2) ◽  
pp. 48-60
Author(s):  
A.G. Salmanov ◽  
A.V. Rudenko

Мета роботи — вивчити резистентність до антибіотиків бактеріальних збудників інфекцій сечових шляхів (ІСШ), виділених у пацієнтів урологічного стаціонару в м. Києві. Матеріали і методи. Досліджено 1612 штамів бактерій, виділених із сечі хворих з ІСШ (цистит, уретрит, пієлонефрит), госпіталізованих в урологічне відділення ДУ «Інститут урології НАМН України» у м. Києві протягом 2016 р. Серед пацієнтів переважали жінки — 1201 (74,5 %). Вік хворих становив від 17 до 74 років. Для збору даних використано медичну документацію лікарні. Мікробіологічні дослідження виконано у лабораторії мікробіології ДУ «Інститут урології НАМН України». Аналізували результати культурального дослідження зразків сечі, зібраних за наявності клінічних ознак ІСШ. Дослідження клінічного матеріалу та інтерпретацію отриманих результатів проводили загальноприйнятими методами. Вивчено чутливість уропатогенів до 31 антибіотика дискодифузійним методом відповідно до рекомендацій Інституту клінічних та лабораторних стандартів США (Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)). Результати та обговорення. Аналіз мікробного спектра сечі виявив домінування серед уропатогенів штамів Escherichia coli (32,0 %), Enterococcus faecalis (19,5 %), Klebsiella pneumoniae (10,9 %), Staphylococcus epidermidis (8,9 %), S. haemolyticus (6,5 %) та Pseudomonas aeruginosa (6,4 %). Частка Enterococcus faecium, Enterobacter aerogenes і Streptococcus viridans становила відповідно 2,5, 2,2 і 1,6 %, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris та Providencia rettgeri — менше 1,0 %. У більшості випадків (69,7 %) мікроорганізми виділено у монокультурі, у решті випадків — у мікробних асоціа- ціях. Високу резистентність до тестованих антибіотиків виявили штами E. aerogenes (45,1 %), E. cloacae (45,7 %), E. faecium (40,9 %), E. faecalis (40,7 %), E. coli (39,9 %), P. aeruginosa (34,0 %), K. pneumoniae (28,6 %). Найбільш активними до уропатогенів були іміпенем (E. coli — 87,6 %, P. aeruginosa — 75,7 %, E. cloacae — 67,3 %, E. aerogenes — 72,6 %, K. pneumoniae — 93,2 %), меропенем (E. coli — 89,1 %, P. aeruginosa — 76,7 %, K. pneumoniae — 82,6 %), лефлоцин (E. coli — 74,5 %, ентерококи — 78,7 %, P. aeruginosa — 76,7 %, E. cloacae — 73,9 %, E. aerogenes — 80,4 %, K. pneumoniae — 83,5 %), амоксицилін/клавуланат (ентерококи — 84,6 %), фурагін (ентерококи — 82,6 %), цефоперазон (K. pneumoniae — 89,2 %, P. aeruginosa — 73,8 %), цефтріаксон (K. pneumoniae — 80,1 %). Висновки. Антибіотикорезистентність збудників ІСШ — важлива терапевтична проблема. Найбільшою активністю до уропатогенів характеризуються іміпенем, меропенем, лефлоцин, амоксицилін/ клавуланат, фурагін, цефоперазон, цефтріаксон, які можна розглядати як препарат вибору для призначення стартової терапії ІСШ. Необхідно здійснювати постійний моніторинг за резистентністю до дії антибіотиків. Політику використання антибіотиків у кожному стаціонарі слід визначати залежно від локальних даних щодо резистентності до протимікробних препаратів.


2020 ◽  
Vol 15 (2) ◽  
pp. 48-52
Author(s):  
O SiddoFarka ◽  
O Abdoualye ◽  
M Doutchi ◽  
A Biraima ◽  
O Amadou ◽  
...  

Objectif : Dans un contexte de ressources limitées, la connaissance du profil des germes contaminant les blocs opératoires et leur résistance aux antibiotiques constitue un maillon de la prévention des infections associées aux soins. Ainsi, l'objectif de notre étude était de déterminer la sensibilité aux antibiotiques des bactéries isolées de l'environnement du bloc opératoire de l'Hôpital National de Zinder. Matériels et Méthodes : Nous avions mené une étude prospective, transversale et descriptive de Janvier à Mars 2020. Les prélèvements avaient été réalisés par écouvillonnage le matin avant le début des activités et avaient concerné les mains et blouses des chirurgiens, le matériel de chirurgie et les équipements du bloc opératoire. Nous avions effectué l'isolement, l'identification et l'antibiogramme des souches bactériennes au niveau du laboratoire de biologie par des techniques conventionnelles classiques. Résultats : Au total, 74 prélèvements avaient été effectués. La culture était positive dans 58,10% des cas (43/74). Les bactéries isolées étaient constituées de 25 souches de Bacillus spp (58,13%), 10 souches de bactéries Gram négatif non fermentaires avec Acinetobacter bamanii (14,0%), Pseudomonas aeruginosa (7,0%) et Stenotrophomonas maltophilia (2,3%) et 8 souches d'entérobactéries représentées par Serratia marcescens (4,7%), Enterobacter cloacae (4,7%), Enterobacter aerogenes (4,7%), Escherichia coli (2,3%) et Klebsiella pneumoniae (2,3%).Concernant la sensibilité des souches aux antibiotiques, une seule souche d'Enterobacter aerogenes était résistante à l'Imipenème et 3 des 9 entérobactéries isolées étaient productrices de bétalactamase à spectre élargi. Conclusion : Au vu de résultats de cette étude, il convient de mettre en place des procédures adaptées en vue d'une meilleure surveillance microbiologique des blocs opératoires. Cela contribuera sans doute à la prévention des infections associées aux soins.


Author(s):  
Rajanikanth Garapati ◽  
N. Ramesh

Objective: In vitro investigated the potential of methanol extracts of micro-propagated C. orchiodes in the antimicrobial property against the three gram-negative bacteria, two gram-positive and one fungal filament.Methods: The micro propagated callus methanol extract was examined against Escherichia coli, Proteus vulgaris, Salmonella typhimurium, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus and Candida albicans. The zone of inhibitions are determined at 10 mg/ml concentration of methanol extracts of callus on agar well plate and MIC against tested microorganism.Results: The highest antibacterial activity recorded in Staphylococcus aureus Bacillus cereus and followed by Candida albicans. Antibacterial activity of leaf extracts of A. reticulata was also significant against the tested microorganisms Escherichia coli, Salmonella typhi, Proteus vulgaris, Pseudomonas aeruginosa compared to ciprofloxacin.Conclusion: Based on the above observations, these extracts were further evaluated for their effect on microorganisms causing infections like typhoid fever, urinary tract infections, septicemia, toxic shock syndrome, skin infection, nosocomial infection, arthritis and diarrhoea. The results also suggest that these plants serve a therapeutic purpose in the treatment bacterial infections.


Medicina ◽  
2011 ◽  
Vol 47 (3) ◽  
pp. 24 ◽  
Author(s):  
Vilma Jurkštienė ◽  
Alvydas Pavilonis ◽  
Daiva Garšvienė ◽  
Algirdas Juozulynas ◽  
Laimutė Samsonienė ◽  
...  

The aim of the study was to determine antimicrobial activity of rhaponticum and shrubby cinquefoil extracts. Material and Methods. Ethanol extract from the leaves of rhaponticum (Rhaponticum carthamoides D.C. Iljin) and shrubby cinquefoil (Potentilla fruticosa L.) was produced at the Department of Food Technology, Kaunas University of Technology. The antimicrobial activity of the viscous extract or rhaponticum and shrubby cinquefoil was evaluated using standard microorganism cultures (bacteria Staphylococcus aureus ATCC 25923, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Escherichia coli ATCC 25922, Klebsiella pneumoniae ATCC 33499, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Proteus mirabilis ATCC 12459, Bacillus subtilis ATCC 6633, Bacillus cereus ATCC 8035 and fungi Candida albicans ATCC 60193). The minimum inhibitory concentration (MIC) of the examined preparations was determined. Results. Both studied preparations – rhaponticum (Rhaponticum carthamoides D.C. Iljin) and shrubby cinquefoil (Potentilla fruticosa L.) – demonstrated similar antimicrobial activity. The highest sensitivity to the studied preparations was observed in microbes with eukaryotic cell structure: Candida albicans, which is a fungus, and a spore-forming prokaryotic bacterium, Bacillus cereus. The highest resistance was observed in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Conclusions. The studied preparations – viscous extracts of rhaponticum and shrubby cinquefoil – are substances with antimicrobial activity against gram-positive (Staphylococcus aureus and Enterococcus faecalis) and gram-negative (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, and Proteus mirabilis) bacteria, spore-forming bacteria (Bacillus subtilis and Bacillus cereus), and fungi (Candida albicans).


2003 ◽  
Vol 58 (11-12) ◽  
pp. 850-854 ◽  
Author(s):  
Ayşen Özdemir Türk ◽  
Meral Yılmaz ◽  
Merih Kıvanç ◽  
Hayrettin Türk

Abstract In this study, the antimicrobial activity of the acetone, diethyl ether and ethanol extracts of the lichen Cetraria aculeata has been investigated. The extracts were tested against twelve bacteria and eight fungi and found active against Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Aeromonas hydrophila, Proteus vulgaris, Streptococcus faecalis, Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Pseudomonas aeruginosa, Listeria monocytogenes. No antimicrobial activity against the fungi was detected. It was determined that only one substance in the extracts has antimicrobial activity and it was characterized as protolichesterinic acid. The MICs of the extracts and protolichesterinic acid were also determined.


2012 ◽  
Vol 7 (9) ◽  
pp. 1934578X1200700 ◽  
Author(s):  
Daniele Fraternale ◽  
Guido Flamini ◽  
Angela Bisio ◽  
Maria Cristina Albertini ◽  
Donata Ricci

This is the first report about the composition of the essential oil of Salvia x jamensis. The major compounds identified by GC-MS were β-caryophyllene (14.8 %), β-pinene (6.8 %), caryophyllene oxide (6.0 %), δ-cadinene (5.5 %), α-pinene (5.2 %) and spatulenol (5.2 %). The oil showed antimicrobial activity against three Gram (+) bacteria: Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, and S. epidermidis, and three Candida strains: C. albicans, C. glabrata and C. tropicalis, while it was inactive against three Gram (-) bacteria: Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Enterobacter cloacae.


2020 ◽  
Vol 17 (1) ◽  
Author(s):  
Rodrigo Luiz Fabri ◽  
Paula Spagnol Da Cunha ◽  
Lara Melo Campos ◽  
Ari Sérgio de Oliveira Lemos ◽  
Elaine Soares Coimbra ◽  
...  

Este presente estudo teve como objetivo investigar o potencial antimicrobiano, leishmanicida e citotóxico do extrato em diclorometano das partes aéreas de Mitracarpus frigidus. Além de identificar as principais classes de metabólitos especiais desse extrato. Para realização dos ensaios biológicos foram testadas nove linhagens de microrganismos (Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella typhimurium, Shigella sonnei, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Bacillus cereus, Candida albicans e Cryptococcus neoformans), duas espécies de Leishmanias (L. amazonensis e L. chagasi). A citotoxicidade foi testada frente ao microcrustáceo Artemia salina. Os resultados mostraram que o extrato em diclorometano apresentou expressiva atividades leishmanicida, frente a ambas formas promastigotas das espécies de Leishmanias, e antimicrobiana, principalmente contra B. cereus e C. neoformans. O ensaio de bioautografia identificou que as classes que possuem atividade antifúngica foram alcaloides e triterpenos. Os resultados apresentados abrem perspectivas para o futuro isolamento, purificação e identificação das substâncias bioativas de Mitracarpus frigidus que possam ser utilizadas no tratamento de infecções microbianas e leishmanioses.


2020 ◽  
Vol 53 (2) ◽  
pp. 135-145
Author(s):  
Gabriela Levorato Pereira ◽  
Amanda Salles Margatho ◽  
Denissani Aparecida Ferrari dos Santos Lima ◽  
Bruna Nogueira Santos ◽  
Paula Elaine Diniz Dos Reis ◽  
...  

Modelo do Estudo: estudo transversal da fase prospectiva de um ensaio clínico. Objetivo: identificar os microrganismos e a sensibilidade antimicrobiana no sítio de inserção do cateter venoso central coberto pelo curativo gel de clorexidina ou pelo filme transparente de poliuretano. Metodologia: estudo transversal, descritivo, realizado com adultos críticos no período de abril a dezembro de 2014 em um hospital universitário no interior do estado de São Paulo. Imediatamente após a retirada do curativo, foi coletada amostra de swab da pele do sítio de inserção do cateter, semeado em placas de Agar sangue e Agar MacConkey e incubadas em estufas bacteriológicas a 35 °C. Nas amostras que apresentaram crescimento bacteriano após 24 horas de incubação, foram realizados testes de sensibilidade aos antimicrobianos utilizando o equipamento automatizado Vitek II (Biomerieux®). Resultados: 45 pacientes fizeram uso do curativo gel de clorexidina e 47 utilizaram o filme transparente de poliuretano. No grupo com o curativo gel de clorexidina houve crescimento dos microrganismos Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Morganella morganii, Enterobacter cloacae, Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis em 13 amostras de swabs. O Staphylococcus aureus apresentou resistência a oxacilina. No grupo do filme transparente de poliuretano seis amostras foram positivas com o crescimento de Serratia marcescens, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticus e Klebsiella pneumoniae, esta resistente a amicacina (Klebsiella pneumoniae carbapenemase - KPC). Conclusão: os resultados demonstram maior crescimento bacteriano no sítio de inserção do cateter venoso central coberto pelo curativo gel de clorexidina quando comparado ao filme transparente de poliuretano.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document