scholarly journals Sphingomonas paucimobilis: Un phénotype de multi-résistance inhabituel chez un probable pathogène émergent

Author(s):  
A Makanera ◽  
M Condé ◽  
MA Diallo ◽  
M Condé ◽  
D Camara

Introduction: La multi-résistance aux antibiotiques devient un phénomène inquiétant chez des bactéries pathogènes et pathogènes émergentes. Objectif: L'objectif de ce travail était de décrire un phénotype de multi-résistance aux antibiotiques chez une souche de Sphingomonas paucimobilis. Patiente et méthodes: Une patiente de 55 ans a été reçue le 29 Novembre 2017 à l'Hôpital de l'Amitié Sino-Guinéenne (Kipé/Conakry) pour des examens cytobactériologiques  des urines. L'identification bactérienne et l'antibiogramme ont été faites à l'automate Vitek2 compact 15 (Biomérieux, Marcy l'Etoile, France). Résultats : L'identification bactérienne a révélé la présence de Sphingomonas paucimobilis. Les antibiogrammes réalisés avec les cartes AST-N 233 et AST-XN05 ont montré une résistance à tous les antibiotiques testés avec des CMI élevées, à l'exception des tétracyclines et du chloramphénicol. Conclusion : Nos résultats montrent que la souche de Sphingomonas paucimobilis étudiée pourrait être considérée comme une bactérie pathogène émergente présentant un phénotype de multi-résistance à différentes familles d'antibiotiques.

Author(s):  
Rosine Manishimwe ◽  
Martin Buhire ◽  
Alexie Uyisunze ◽  
Jean Bosco Turikumwenayo ◽  
Michael Tukei

La résistance aux antibiotiques est devenue une préoccupa­tion de santé publique mondiale car un grand nombre de bactéries résistantes émergent continuellement. Les animaux ont été signalés comme l’une des sources de bactéries résistantes aux antibiotiques qui peuvent être transférées aux humains. Afin d’enrichir les données sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux au Rwanda, une étude transversale a été menée dans la province de l’Est et dans la ville de Kigali pour isoler Escherichia coli présent dans des élevages de volailles en plein air et dans des élevages commerciaux. Des échan­tillons de matières fécales ont été prélevés dans 294 fermes avicoles et des souches d’E. coli ont été isolées et identifiées. Au total, 241 isolats d’E. coli ont été soumis à un test de sen­sibilité aux antibiotiques en utilisant cinq antibiotiques (gen­tamicine, streptomycine, rifampicine, doxycycline et érythro­mycine). L’utilisation d’antibiotiques chez les volailles était faible dans les élevages de volaille en plein air (30,9 %) com­parativement aux élevages de poules pondeuses et de pou­lets de chair (100 %). Parmi les 151 éleveurs qui ont déclaré utiliser des antibiotiques chez les volailles, près de la moitié (49,7 %) ont toujours utilisé des antibiotiques sur ordonnance vétérinaire. Sur les 241 isolats d’E. coli, 43,2 % présentaient une résistance multiple à quatre des cinq antibiotiques testés. Presque tous les isolats (98,8 %) étaient résistants à l’érythro­mycine, 78,8 % étaient résistants à la streptomycine, 77,6 % étaient résistants à la doxycycline, 69,3 % étaient résistants à la rifampicine et quelques-uns seulement étaient résistants à la gentamicine (3,7 %). Aucune différence significative statis­tiquement n’a été observée en ce qui concerne la résistance des isolats aux antibiotiques selon le type de système d’éle­vage. Toutefois, la résistance des isolats à la doxycycline a été significativement plus élevée dans les fermes où l’utilisa­tion d’antibiotiques a été signalée (84 %) que dans les fermes où l’utilisation d’antibiotiques n’a pas été signalée (70 %). La résistance aux antibiotiques d’E. coli observée montre l’exis­tence d’une source potentielle de résistance qui peut être transférée aux bactéries pathogènes et avoir un impact sur les humains et les animaux.


2021 ◽  
Vol 22 (1) ◽  
pp. 52-59
Author(s):  
Z.D. Rakotovao-Ravahatra ◽  
F.M. Randriatsarafara ◽  
A.L. Rakotovao ◽  
A. Rasamindrakotroka

Background: The extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae are a major cause of nosocomial bacteraemia. The objectives of this study are to describe the antibiotic resistance pattern of ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia and identify factors associated with these infections in a University Hospital in Madagascar.Methodology: This is a descriptive cross-sectional study of 300 randomly selected patients with clinical features of bacteraemia whose blood cultures were processed for isolation and identification of bacterial pathogens over a period of six months (October 2019 to March 2020) at the laboratory of the University Hospital of Befelatanana. Blood culture samples were processed by conventional microbiological method for isolation of Enterobacteriaceae, which were identified to species level using Analytical Profile Index (API) 20E® test system. Antibiotic susceptibility of each isolate was performed by the disk diffusion technique and ESBL production was detected by the ‘synergy’ method.Results: Of the 300 patients, 54 were positive for bacteria, giving a prevalence rate of 18% for microbiologically documented bacteraemia. Of the 54 bacterial pathogens, Enterobacteriaceae isolates constituted 37 (68.5%), with 23 (42.6%) being ESBL producing and 14 (25.9%) non-ESBL producing isolates, 14 (25.9%) were staphylococci and 3 (5.6%) were streptococci isolates. All 23 (100%) ESBL producing Enterobacteriaceae isolates were resistant to amoxicillin, amoxicillin-clavulanic acid and the third generation cephalosporins (3GC), 19 (82.6%) to gentamycin and 18 (78.3%) to cotrimoxazole. On the other hand, the non-ESBL producing isolates were more sensitive because only 10 (71%) were resistant to amoxicillin, 7 (50%)to cotrimoxazole, 2 (14%) to amoxicillin-clavulanic acid, 1 (7.1%) to gentamycin, and none (0%) was resistant to 3GC. All 54 Enterobacteriaceae isolates were sensitive to amikacin and imipenem. Age less than 20 years (93.8%) (p=0.001) and hospitalization in intensive care units (90.9%) (p=0.04) were significant risk factors associated with infection by ESBL producing Enterobacteriaceae.Conclusion: ESBL producing Enterobacteriaceae responsible for bacteraemia in University Hospital of Befelatanana, Madagascar, are resistant to many classes of antibiotics. Carbapenems and amikacin are the antibiotics of choice. Keywords: ESBL, Enterobacteriaceae, bacteraemia, antibiotic resistance   French Title: Prévalence et facteurs associés à la bactériémie à entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu dans l'hôpital universitaire de Befelatanana, Madagascar Contexte: Les entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu (BLSE) sont une cause majeurede bactériémie nosocomiale. Les objectifs de cette étude sont de décrire le profil de résistance aux antibiotiques des entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie et d'identifier les facteurs associés à ces infections dans un hôpital universitaire de Madagascar.Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale descriptive de 300 patients sélectionnés au hasard présentantdes caractéristiques cliniques de bactériémie dont les hémocultures ont été traitées pour l'isolement etl'identification des bactéries pathogènes sur une période de six mois (octobre 2019 à mars 2020) au laboratoiredu Hôpital universitaire de Befelatanana. Les échantillons d'hémoculture ont été traités par une méthodemicrobiologique conventionnelle pour l'isolement des entérobactéries, qui ont été identifiées au niveau del'espèce à l'aide du système de test Analytical Profile Index (API) 20E®. La sensibilité aux antibiotiques dechaque isolat a été réalisée par la technique de diffusion sur disque et la production de BLSE a été détectée parla méthode «synergie».Résultats: Sur les 300 patients, 54 étaient positifs pour les bactéries, ce qui donne un taux de prévalence de18% pour une bactériémie microbiologiquement documentée. Parmi les 54 bactéries pathogènes, les isolatsd'entérobactéries constituaient 37 (68,5%), 23 (42,6%) produisant des BLSE et 14 (25,9%) isolats neproduisant pas de BLSE, 14 (25,9%) étaient des staphylocoques et 3 (5,6%) l'étaient isolats de streptocoques.Les 23 isolats (100%) de BLSE produisant des Enterobacteriaceae étaient tous résistants à l'amoxicilline, àl'amoxicilline-acide clavulanique et aux céphalosporines de troisième génération (3GC), 19 (82,6%) à lagentamycine et 18 (78,3%) au cotrimoxazole. En revanche, les isolats non producteurs de BLSE étaient plussensibles car seuls 10 (71%) étaient résistants à l'amoxicilline, 7 (50%) au cotrimoxazole, 2 (14%) àl'amoxicilline-acide clavulanique, 1 (7,1%) à la gentamycine, et aucun (0%) n'était résistant à la 3GC. Les 54isolats d'Enterobacteriaceae étaient tous sensibles à l'amikacine et à l'imipénème. L'âge de moins de 20 ans(93,8%) (p=0,001) et l'hospitalisation en unité de soins intensifs (90,9%) (p=0,04) étaient des facteurs derisque importants associés à l'infection par les entérobactéries productrices de BLSE.Conclusion: Les entérobactéries productrices de BLSE responsables de bactériémie à l'hôpital universitaire deBefelatanana, Madagascar, sont résistantes à de nombreuses classes d'antibiotiques. Les carbapénèmes etl'amikacine sont les antibiotiques de choix. Mots clés: BLSE, entérobactéries, bactériémie, résistance aux antibiotiques    


Author(s):  
Н. Маляр ◽  
И. С. Охрименко ◽  
Л. Е. Петровская ◽  
А. А. Алексеев ◽  
К. В. Ковалев ◽  
...  

2008 ◽  
Vol 43 (1) ◽  
pp. 55-62 ◽  
Author(s):  
Linda Wojcicka ◽  
Carole Baxter ◽  
Ron Hofmann

Abstract Microorganisms have been shown to survive drinking water disinfection and remain viable in disinfected waters despite the presence of disinfectant residuals. This may be partially attributed to protection by particulate matter. The aim of this study was to determine the effects of the presence of particulate matter on disinfection kinetics. Sphingomonas paucimobilis ATCC 10829 and Helicobacter pylori ATCC 43504 were used in inactivation experiments in the presence and absence of soil, corrosion, and wastewater particles. The results showed that the presence of such particles tended to inhibit chlorine and monochloramine inactivation, although the magnitude of the impact under the conditions tested was small (e.g., 1-log reduction in inactivation for several minutes of contact time in the presence of less than 1 mg/L of disinfectant).


2005 ◽  
Vol 187 (15) ◽  
pp. 5067-5074 ◽  
Author(s):  
Daisuke Kasai ◽  
Eiji Masai ◽  
Keisuke Miyauchi ◽  
Yoshihiro Katayama ◽  
Masao Fukuda

ABSTRACT Sphingomonas paucimobilis SYK-6 converts vanillate and syringate to protocatechuate (PCA) and 3-O-methylgallate (3MGA) in reactions with the tetrahydrofolate-dependent O-demethylases LigM and DesA, respectively. PCA is further degraded via the PCA 4,5-cleavage pathway, whereas 3MGA is metabolized via three distinct pathways in which PCA 4,5-dioxygenase (LigAB), 3MGA 3,4-dioxygenase (DesZ), and 3MGA O-demethylase (LigM) are involved. In the 3MGA O-demethylation pathway, LigM converts 3MGA to gallate, and the resulting gallate appears to be degraded by a dioxygenase other than LigAB or DesZ. Here, we isolated the gallate dioxygenase gene, desB, which encodes a 418-amino-acid protein with a molecular mass of 46,843 Da. The amino acid sequences of the N-terminal region (residues 1 to 285) and the C-terminal region (residues 286 to 418) of DesB exhibited ca. 40% and 27% identity with the sequences of the PCA 4,5-dioxygenase β and α subunits, respectively. DesB produced in Escherichia coli was purified and was estimated to be a homodimer (86 kDa). DesB specifically attacked gallate to generate 4-oxalomesaconate as the reaction product. The Km for gallate and the V max were determined to be 66.9 ± 9.3 μM and 42.7 ± 2.4 U/mg, respectively. On the basis of the analysis of various SYK-6 mutants lacking the genes involved in syringate degradation, we concluded that (i) all of the three-ring cleavage dioxygenases are involved in syringate catabolism, (ii) the pathway involving LigM and DesB plays an especially important role in the growth of SYK-6 on syringate, and (iii) DesB and LigAB are involved in gallate degradation.


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