Plasmid DNA analysis, biotyping, and antimicrobic susceptibility as subtyping tests for Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca

1993 ◽  
Vol 16 (1) ◽  
pp. 35-41 ◽  
Author(s):  
Alan I. Hartstein ◽  
Virginia H. Morthland ◽  
J.William Rourke ◽  
Renee Sykes ◽  
Abdel L. Rashad
2017 ◽  
Vol 1 (2) ◽  
pp. 48-60
Author(s):  
A.G. Salmanov ◽  
A.V. Rudenko

Мета роботи — вивчити резистентність до антибіотиків бактеріальних збудників інфекцій сечових шляхів (ІСШ), виділених у пацієнтів урологічного стаціонару в м. Києві. Матеріали і методи. Досліджено 1612 штамів бактерій, виділених із сечі хворих з ІСШ (цистит, уретрит, пієлонефрит), госпіталізованих в урологічне відділення ДУ «Інститут урології НАМН України» у м. Києві протягом 2016 р. Серед пацієнтів переважали жінки — 1201 (74,5 %). Вік хворих становив від 17 до 74 років. Для збору даних використано медичну документацію лікарні. Мікробіологічні дослідження виконано у лабораторії мікробіології ДУ «Інститут урології НАМН України». Аналізували результати культурального дослідження зразків сечі, зібраних за наявності клінічних ознак ІСШ. Дослідження клінічного матеріалу та інтерпретацію отриманих результатів проводили загальноприйнятими методами. Вивчено чутливість уропатогенів до 31 антибіотика дискодифузійним методом відповідно до рекомендацій Інституту клінічних та лабораторних стандартів США (Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)). Результати та обговорення. Аналіз мікробного спектра сечі виявив домінування серед уропатогенів штамів Escherichia coli (32,0 %), Enterococcus faecalis (19,5 %), Klebsiella pneumoniae (10,9 %), Staphylococcus epidermidis (8,9 %), S. haemolyticus (6,5 %) та Pseudomonas aeruginosa (6,4 %). Частка Enterococcus faecium, Enterobacter aerogenes і Streptococcus viridans становила відповідно 2,5, 2,2 і 1,6 %, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris та Providencia rettgeri — менше 1,0 %. У більшості випадків (69,7 %) мікроорганізми виділено у монокультурі, у решті випадків — у мікробних асоціа- ціях. Високу резистентність до тестованих антибіотиків виявили штами E. aerogenes (45,1 %), E. cloacae (45,7 %), E. faecium (40,9 %), E. faecalis (40,7 %), E. coli (39,9 %), P. aeruginosa (34,0 %), K. pneumoniae (28,6 %). Найбільш активними до уропатогенів були іміпенем (E. coli — 87,6 %, P. aeruginosa — 75,7 %, E. cloacae — 67,3 %, E. aerogenes — 72,6 %, K. pneumoniae — 93,2 %), меропенем (E. coli — 89,1 %, P. aeruginosa — 76,7 %, K. pneumoniae — 82,6 %), лефлоцин (E. coli — 74,5 %, ентерококи — 78,7 %, P. aeruginosa — 76,7 %, E. cloacae — 73,9 %, E. aerogenes — 80,4 %, K. pneumoniae — 83,5 %), амоксицилін/клавуланат (ентерококи — 84,6 %), фурагін (ентерококи — 82,6 %), цефоперазон (K. pneumoniae — 89,2 %, P. aeruginosa — 73,8 %), цефтріаксон (K. pneumoniae — 80,1 %). Висновки. Антибіотикорезистентність збудників ІСШ — важлива терапевтична проблема. Найбільшою активністю до уропатогенів характеризуються іміпенем, меропенем, лефлоцин, амоксицилін/ клавуланат, фурагін, цефоперазон, цефтріаксон, які можна розглядати як препарат вибору для призначення стартової терапії ІСШ. Необхідно здійснювати постійний моніторинг за резистентністю до дії антибіотиків. Політику використання антибіотиків у кожному стаціонарі слід визначати залежно від локальних даних щодо резистентності до протимікробних препаратів.


2017 ◽  
Vol 61 (8) ◽  
Author(s):  
Astrid V. Cienfuegos-Gallet ◽  
Liang Chen ◽  
Barry N. Kreiswirth ◽  
J. Natalia Jiménez

ABSTRACT Here we describe the spread of colistin resistance in clinical isolates of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in Medellín, Colombia. Among 32 isolates collected between 2012 and 2014, 24 showed genetic alterations in mgrB. Nineteen isolates belonged to sequence type 512 (ST512) (or its single locus variant [SLV]) and harbored an 8.1-kb hsdMSR insertion corresponding to ISKpn25, indicating a clonal expansion of the resistant strain. The insertion region showed 100% identity to several plasmids, suggesting that the colistin resistance is mediated by chromosomal integration of plasmid DNA.


2012 ◽  
Vol 30 (5) ◽  
pp. 246-248
Author(s):  
José M. Rodríguez-Martínez ◽  
M. Carmen Conejo ◽  
Paula Díaz de Alba ◽  
Lorena López-Cerero ◽  
Pedro Fernandez-Echauri ◽  
...  

2021 ◽  
Vol 6 (14) ◽  
pp. 51-55
Author(s):  
Ülkü VERANYURT ◽  
Betül AKALIN

Background: Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) infections are a significant threat to public health due to the limited availability of antibiotics and the effect on mortality. This study was conducted retrospectively to determine the prevalence of CRE in a teaching and research hospital in Istanbul. Materials and Methods: In 2016, 2017 and in the first half of 2018 Klebsiella species were evaluated retrospectively in culture samples that were sent to Microbiology Laboratory in an educational hospital. The typing of Klebsiella species were performed with MALDITOF-MS device (Biomerieux, France). Imipenem, merapenem, ertapenem susceptibilities of the strains were evaluated with VITEC2 Compact (Biomerieux, France) according to EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing). If the strains were found to be resistant, the results were confirmed by the antibiotic gradient test. Results: In our study, 257 samples; Klebsiella oxytoca 9 (3.49%) and Klebsiella pneumoniae 248 (96.51%) were detected. 130 endotracheal aspirates, 57 wounds, 34 blood, 15 urine, 9 sputum, 3 catheters, 4 tissue biopsies, 2 mediastinum, 2 peritoneal fluid and 1 pleural fluid strains were identified. While none of the Klebsiella oxytoca strains were resistant to carbapenems, the percentages of Klebsiella pneumoniae resistance against imipenem, merapenem and ertapenem were found to be 23.29%, 16.94% and 29.44% respectively. Conclusion: The increasing problem of carbapenem-resistant (CR) Klebsiella pneumoniae in the last decade has been observed in our hospital for the last 2 years. CR strains often show increased resistance to other antibiotics and their treatment possibilities are limited. It increases the importance of controlling this factor. The application of effective infection control programs and the use of rational antibiotics are of great importance.


2008 ◽  
Vol 53 (3) ◽  
pp. 1256-1259 ◽  
Author(s):  
A. Zioga ◽  
J. M. Whichard ◽  
S. D. Kotsakis ◽  
L. S. Tzouvelekis ◽  
E. Tzelepi ◽  
...  

ABSTRACT Two CMY-2 derivatives, CMY-31 (Gln215→Arg) from Salmonella enterica serotype Newport and CMY-36 (Ala77→Cys and Gln193→Glu) from Klebsiella pneumoniae, were characterized. Both cephalosporinases functionally resembled CMY-2. bla CMY alleles occurred as parts of a putative transposon comprising ISEcp1B and a Citrobacter freundii-derived sequence carried by ColE1-like plasmids similar to CMY-5-encoding pTKH11 from Klebsiella oxytoca.


2012 ◽  
Vol 35 (22) ◽  
pp. 3208-3216 ◽  
Author(s):  
Clarence M. Ongkudon ◽  
Emma Hodges ◽  
Kathleen Murphy ◽  
Michael K. Danquah

Author(s):  
Ewerton Fylipe De Araújo Silva ◽  
Joanna Francyne Silva de Barros ◽  
Kleber Botelho Fraga ◽  
Carolina Peixoto Magalhães ◽  
José Eduardo Garcia ◽  
...  

O conhecimento das enterobactérias presentes em Gavião-carijó pode trazer uma compreensão sobre as doenças infecciosas que podem acometer essa ave, como também outros animais e/ou humanos, além de trazer mais informações sobre essa espécie de grande importância ecológica. Desta forma, o objetivo do estudo foi determinar as enterobactérias presentes na cloaca de Gaviões-carijós cativos e seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianos. Inicialmente, foram coletadas amostras cloacais de nove espécimes com o auxílio de swabs. As amostras foram plaqueadas em ágar MacConkey, ágar Hektoen, ágar EMB e ágar SS e incubadas por 24 h a 35°C. Após incubação, as colônias foram submetidas às provas bioquímicas para confirmação da presença de enterobactérias. Posteriormente, o perfil de susceptibilidade das bactérias frente a agentes antimicrobianos foi avaliado através do teste da difusão em disco de acordo com o Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Escherichia coli (77,8%), Klebsiella oxytoca (11,1%), Klebsiella pneumoniae (11,1%) e Salmonella spp. (55,6%) foram isoladas das amostras coletadas. Dentre as cepas isoladas, algumas apresentaram resistência a até três antimicrobianos. O presente estudo trouxe um maior conhecimento sobre as enterobactérias presentes no Gavião-carijó (Rupornis magnirostris), mostrando um percentual significativo de enterobactérias de importância na saúde pública, evidenciando também a ocorrência de cepas com perfil de resistência a agentes antimicrobianos.


1996 ◽  
Vol 40 (2) ◽  
pp. 342-348 ◽  
Author(s):  
L Martínez-Martínez ◽  
S Hernández-Allés ◽  
S Albertí ◽  
J M Tomás ◽  
V J Benedi ◽  
...  

Four Klebsiella pneumoniae isolates (LB1, LB2, LB3, and LB4) with increased antimicrobial resistance were obtained from the same patient. The four isolates were indistinguishable in biotype, plasmid content, lipopolysaccharide, and DNA analysis by pulse-field gel electrophoresis. Isolate LB1 made TEM-1 and SHV-1 beta-lactamases. Isolates LB2, LB3, and LB4 produced SHV-5 in addition to TEM-1 and SHV-1. MICs of cefoxitin, ceftazidime, and cefotaxime against LB1 were 4, 1, and 0.06 micrograms/ml, respectively. MICs of ceftazidime against K. pneumoniae LB2, LB3, and LB4 were > 256 micrograms/ml, and those of cefotaxime were 2, 4, and 64 micrograms/ml, respectively. MICs of cefoxitin against K. pneumoniae LB2 and LB3 were 4 micrograms/ml, but that against K. pneumoniae LB4 was 128 micrgrams/ml. K. pneumoniae LB4 could transfer resistance to ceftazidime and cefotaxime, but not that to cefoxitin, to Escherichia coli. Isolate LB4 and cefoxitin-resistant laboratory mutants lacked an outer membrane protein of about 35 kDa whose molecular mass, mode of isolation, resistance to proteases, and reaction with a porin-specific antiserum suggested that it was a porin. MICs of cefoxitin and cefotaxime reverted to 4 and 2 micrograms/ml, respectively, when isolate LB4 was transformed with a gene coding for the K. pneumoniae porin OmpK36. We conclude that the increased resistance to cefoxitin and expanded-spectrum cephalosporins of isolate LB4 was due to loss of a porin channel for antibiotic uptake.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document