scholarly journals PERFIL MOLECULAR DE CANDIDA PARAPSILOSIS ISOLADAS DO AMBIENTE DE UMA UNIDADE DE TERAPIA INTENSIVA NEONATAL

2021 ◽  
Author(s):  
Meliza Arantes de Souza Bessa ◽  
Priscila Guerino Vilela Alves ◽  
Mário Paulo Amante Penatti ◽  
Denise Von Dolinger De Brito Röder ◽  
Ralciane De Paula Menezes
Keyword(s):  
Candida Parapsilosis ◽  
Candida Spp ◽  
Rapd Pcr ◽  
Random Amplification ◽  
Terapia Intensiva

Introdução: Candida spp. é o principal patógeno oportunista do reino Fungi que acomete indivíduos internados em serviços de saúde, sendo Candida parapsilosis a segunda espécie mais comum em amostras clínicas de recém-nascidos. Infecções desencadeadas pelo gênero Candida colocam em risco a saúde e desenvolvimento de neonatos críticos em função de sua maior susceptibilidade. Existem poucos relatos na literatura que avaliam a semelhança genética entre os isolados provenientes do ambiente hospitalar. Objetivo: Analisar o perfil molecular de isolados de C. parapsilosis provenientes do ambiente da Unidade de Terapia Intensiva Neonatal de um hospital universitário. Material e métodos: Foram incluídos no estudo isolados do complexo C. parapsilosis provenientes do ambiente da unidade. Através da técnica Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD-PCR) e utilizando quatro primers (OPA09, OPB11, OPA18 e OPG17) buscou-se avaliar a similaridade genética entre esses isolados. Para análise do RAPD-PCR, os produtos de amplificação do DNA foram submetidos à eletroforese em gel de agarose (2%). As bandas de amplificação observadas nos géis foram transformadas em matrizes de valores binários utilizando o programa estatístico Mult-Variate Statistical Package versão 3.21. As relações genéticas foram calculadas através do coeficiente de Jaccard (Sj), onde valores de Sj igual a 1,00 indicam o mesmo genótipo, valores entre 0,80 a 0,99 representam alta similaridade e valores inferior a 0,80 sugerem amostras distintas. Resultados: Dos cinco isolados analisados, quatro (80%) apresentaram alta similaridade entre si (Sj > 0,90) sendo que três desses (60%) apresentaram o mesmo genótipo (Sj = 1,00), os quais foram obtidos de diferentes leitos (2), da mesa de medicação e gaveta de armário, com um intervalo de 97 dias entre as coletas. Conclusão: O estudo sugere que o ambiente nosocomial pode ser um importante reservatório de C. parapsilosis, favorecendo sua permanência e disseminação pela unidade. Assim faz-se necessário reforçar a limpeza do ambiente hospitalar e estabelecer medidas de controle e prevenção a fim de evitar disseminação e consequentemente infecções invasivas.

scholarly journals Candidemia neonatal, em hospital público do Mato Grosso do Sul

2008 ◽  
Vol 41 (5) ◽  
pp. 459-463 ◽  
Author(s):  
Paula Cristhina Niz Xavier ◽  
Marilene Rodrigues Chang ◽  
Maína O. Nunes ◽  
Durval B. Palhares ◽  
Renato Andreotti e Silva ◽  
...  
Keyword(s):  
Candida Albicans ◽  
Candida Parapsilosis ◽  
Candida Spp ◽  
Mato Grosso ◽  
Rapd Pcr ◽  
Terapia Intensiva ◽  
Mato Grosso Do Sul

O objetivo de nosso estudo foi realizar tipagem molecular de 25 amostras clínicas de Candida spp, isoladas de crianças com candidemia, internadas na unidade de terapia intensiva neonatal de um Hospital Universitário entre 1998 a 2006. Dados demográficos e clínicos foram obtidos de prontuários para conhecimento dos aspectos clínicos e epidemiológicos. Identificação das leveduras foi feita por método convencional e a susceptibilidade antifúngica por método de microdiluição. O perfil genético foi determinado pela técnica de RAPD-PCR. Candida albicans (11; 44%) e Candida parapsilosis (10; 40%) foram as mais isoladas. Dezessete (68%) dos recém-nascidos tinham peso inferior a 1.500g. Prematuridade (92%), uso de cateter venoso central (100%), foram as condições de risco mais associados. Dezenove (76%) pacientes foram a óbito. Apenas uma cepa de Candida parapsilosis, mostrou ser sensível dose dependente ao fluconazol. Na análise molecular, foram observados 11 padrões genéticos distintos. Somente em dois casos foi observada relação epidemiológica, sugerindo mesma fonte de infecção.

scholarly journals Candidemia em um hospital terciário brasileiro: incidência, freqüência das diferentes espécies, fatores de risco e suscetibilidade aos antifúngicos

2008 ◽  
Vol 41 (1) ◽  
pp. 23-28 ◽  
Author(s):  
João Cesar Beenke França ◽  
Clea Elisa Lopes Ribeiro ◽  
Flávio de Queiroz-Telles
Keyword(s):  
Candida Albicans ◽  
Candida Tropicalis ◽  
Candida Glabrata ◽  
Candida Parapsilosis ◽  
Candida Krusei ◽  
Candida Spp ◽  
Terapia Intensiva

São apresentados os resultados de estudo transversal e observacional sobre candidemia realizado no Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná. No período de janeiro de 2001 a dezembro de 2004, foram analisados 100 episódios de candidemia. A incidência foi de 1,27 por 1.000 internações, sendo Candida spp o oitavo agente mais isolado nas infecções da corrente sanguínea. A idade variou de 5 dias a 89 anos com uma média de 32 anos, 60% dos casos ocorreram em adultos (66% > 50 anos) e 40% em crianças (52% < 1 ano). Cinqüenta e nove pacientes estavam internados em enfermarias e 41 em unidade de terapia intensiva. Candida albicans foi a espécie mais (59%) freqüente, seguida por Candida tropicalis (15%), Candida parapsilosis (9%). As condições associadas mais (97%) freqüentes foram uso de antibióticos, cateter venoso central (77%), bloqueador H2 (57%), nutrição parenteral total (49%) internamento em unidade de terapia intensiva (41%). Dos 51 isolados testados, 3 de Candida glabrata apresentaram suscetibilidade dose-dependente ao fluconazol e eram resistentes ao itraconazol. Uma amostra de Candida krusei apresentou suscetibilidade dose-dependente ao fluconazol, e uma de Candida pelliculosa suscetibilidade dose-dependente ao itraconazol. Na população de estudo, 68% receberam tratamento antifúngico, no entanto a mortalidade foi de 56%.

An Outbreak of ESBL-producing Klebsiella pneumoniae in an Iranian Referral Hospital: Epidemiology and Molecular Typing

2019 ◽  
Vol 19 (1) ◽  
pp. 46-54 ◽  
Author(s):  
Shima Mahmoudi ◽  
Babak Pourakbari ◽  
Aliakbar Rahbarimanesh ◽  
Mohammad Reza Abdosalehi ◽  
Keyghobad Ghadiri ◽  
...  
Keyword(s):  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Nosocomial Infections ◽  
Molecular Typing ◽  
Genetic Relatedness ◽  
Referral Hospital ◽  
Limited Information ◽  
Hospital Epidemiology ◽  
Rapd Pcr ◽  
Published Report ◽  
Random Amplification

Introduction: Klebsiella pneumoniae is a common cause of nosocomial infections; however, there is limited information in Iran regarding nosocomial outbreaks due to extended-spectrum &amp;#946;–lactamase (ESBL) producing K pneumoniae strains, particularly using molecular methods. The present study focused on the molecular mechanism of ESBL resistance and genetic relatedness in K. pneumoniae isolates causing nosocomial infections in an Iranian referral hospital. Material and Methods: This study evaluated the antimicrobial resistance and molecular epidemiology of K. pneumoniae causing nosocomial infections in children between October 2013 and March 2014. The ESBL detection was carried out for all the isolates by the CLSI method and PCR was carried out for the detection of the blaSHV, blaTEM, and blaCTX-M genes among ESBL-producing K. pneumonia. Molecular typing of the K. pneumoniae was performed using random amplification of polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR). Results: A total of 30 isolates of K. pneumoniae were used for epidemiological analysis. High rates of resistance to cefotaxime (n=29, 97%), cefazolin (n=29, 97%), cefepime (n=25, 83%) and gentamicin (n=23, 77%) were observed. A total of 29 strains (97%) produced ESBLs. The frequency of blaSHV, blaCTX-M and blaTEM genes among these isolates was 83% (n=25), 70% (n=21) and 57% (n=17), respectively. Surprisingly 11 isolated (37%) carried blaSHV, blaCTX-M and blaTEM genes simultaneously. Moreover, the concurrent presence of “blaSHV and blaCTX-M” and “blaSHV and blaTEM” was seen in 8 (27%) and 4 (13%) isolates, respectively. RAPDPCR analyses revealed that K. pneumoniae isolates belonged to 2 RAPD-PCR types among which one cluster counted for 28 isolates. Conclusion: To our knowledge, this is the first published report of a nosocomial outbreak of ESBL-producing K. pneumoniae in children in Iran. Although the epidemiology of nosocomial infections with ESBL-producing organisms has not yet been explored in depth in Iran, our findings suggest that ESBL-producing organisms are already an established public health threat in our country.

scholarly journals Fatores de risco associados à colonização por Candida spp em neonatos internados em uma Unidade de Terapia Intensiva Neonatal brasileira

2009 ◽  
Vol 42 (4) ◽  
pp. 431-435 ◽  
Author(s):  
Raniery Martins Borges ◽  
Leandro Rafael Soares ◽  
Cristiane Silveira de Brito ◽  
Denise Von Dolinger de Brito ◽  
Vânia Olivetti Steffen Abdallah ◽  
...  
Keyword(s):  
Candida Albicans ◽  
Candida Spp ◽  
National Healthcare ◽  
National Healthcare Safety Network ◽  
Terapia Intensiva

Os objetivos desse estudo foram investigar a participação de Candida albicans e não-albicans como agente de colonização e sepse, bem como os fatores de risco associados aos neonatos internados na Unidade de Terapia Intensiva Neonatal do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia. Foi realizada vigilância epidemiológica pelo sistema National Healthcare Safety Network no período entre agosto de 2007 e abril de 2008. A taxa de incidência de sepse com critério microbiológico foi de 6,7/1.000 paciente/dia, constatando-se apenas um caso de candidemia. Aproximadamente, 19% dos neonatos estavam colonizados por Candida, identificadas como Candida albicans (50%) e Candida não-albicans (50%). Os fatores de risco significantes para colonização por Candida spp foram a idade gestacional entre 26 e 30 semanas, o uso prévio de antibiótico e o cateter vascular central umbilical. A mortalidade total foi de 11,8% nos neonatos internados durante o período de estudo com sepse, porém o recém-nascido com candidemia não evoluiu para óbito.

Involvement of a pasteurizer in the contamination of milk by Bacillus cereus in a commercial dairy plant

2000 ◽  
Vol 67 (3) ◽  
pp. 455-460 ◽  
Author(s):  
BIRGITTA SVENSSON ◽  
ÅSA ENEROTH ◽  
JOHANNE BRENDEHAUG ◽  
GÖRAN MOLIN ◽  
ANDERS CHRISTIANSSON
Keyword(s):  
Bacillus Cereus ◽  
Raw Milk ◽  
Pasteurized Milk ◽  
Rapd Pcr ◽  
Random Amplification ◽  
Dairy Plant ◽  
Heat Activation ◽  
Contamination Routes ◽  
Microbiological Analyses

Bacillus cereus is a common contaminant in raw milk. The spores survive pasteurization and psychrotrophic strains of B. cereus often limit the keeping quality of pasteurized milk stored at > 6 °C (Griffiths, 1992). High numbers of B. cereus in pasteurized milk are most frequent when the cows are grazing (Slaghuis et al. 1997), mainly owing to increased levels of spores in raw milk resulting from teat contamination by soil (Christiansson et al. 1999). However, high numbers can also be found in pasteurized milk while the cows are housed indoors, and this is probably caused by additional contamination at the dairy plant (te Giffel et al. 1996; Larsen & Jørgensen, 1997; Lin et al. 1998). There is little information available about the sites of recontamination in the dairy. The use of typing techniques capable of discrimination below the species level, such as fatty acid profiles and random amplification of polymorphic DNA–polymerase chain reaction (RAPD–PCR), could be helpful in demonstrating contamination routes (Lin et al. 1998; Nilsson et al. 1998).Spores of B. cereus are very hydrophobic and readily adhere to surfaces of steel, glass and rubber (Rönner et al. 1990), and short cleaning-in-place programmes do not always eliminate all the spores (Rönner & Husmark, 1992). Spores adhering to surfaces are more difficult to eliminate by disinfectants than spores in solution (te Giffel et al. 1995). Many B. cereus spores germinate rapidly in milk upon heat activation and, if allowed to propagate undisturbed on surfaces, may form biofilms that are extremely difficult to eliminate (Mosteller & Bishop, 1993; Wirtanen et al. 1996; Kumar & Anand, 1998).This paper describes how we demonstrated the involvement of a pasteurizer in the contamination of pasteurized milk by B. cereus in a commercial dairy plant using a combination of classic microbiological analyses and typing of strains by RAPD–PCR.

scholarly journals INCIDENCES OF CANDIDA ALBICANS AND NON-ALBICANS AMONG CATHETER-ASSOCIATED URINARY TRACT INFECTION PATIENTS OF AKOLA CITY

2017 ◽  
Vol 10 (11) ◽  
pp. 115
Author(s):  
Khandare Ln ◽  
Barate Dl
Keyword(s):  
Urinary Tract Infection ◽  
Candida Albicans ◽  
Urinary Tract ◽  
Tract Infection ◽  
Candida Parapsilosis ◽  
Opportunistic Infections ◽  
Urine Samples ◽  
Age Group ◽  
Candida Spp ◽  
Catheter Urine

Objective: Candida spp. is the third leading cause of catheter-related infections. Candida species is a part of human microflora and it becomes pathogenic when certain conditions are present and cause an opportunistic infections. The present study was undertaken to determine incidences of Candida albicans and non-albicans among catheterized urinary tract infection (UTI) patients of Akola city.Methods: A total 60 catheter urine samples were collected from patient of all the age group and both sex who had indwelling urinary catheter. The collected catheterized urine samples of patients from various hospitals of Akola city were used for isolation using HiCrome Candida differential agar.Results: It was found that highest frequency of isolation of Candida spp. was from age group 61-70 years. The predominance of male candidate was more than female having Candida spp. in catheter-associated UTI (C-UTI). Among the Candida spp. C. albicans (64.81%) was predominant over non-albicans spp. while in non-albicans Candida krusei and Candida glabrata were predominant showing 11.11% incidences. It was followed by Candida tropicalis (9.2%) and Candida parapsilosis (3.7%).Conclusion: The incidences of C. albicans and non-albicans were high among catheter-associated UTI patients.

scholarly journals Increase in Candida parapsilosis candidemia in cancer patients

2019 ◽  
Vol 11 (1) ◽  
Author(s):  
Mingyue Sun ◽  
Chunguang Chen ◽  
Weiqiang Xiao ◽  
Yanmin Chang ◽  
Cailin Liu ◽  
...  
Keyword(s):  
Risk Factors ◽  
Parenteral Nutrition ◽  
Cancer Patients ◽  
Candida Parapsilosis ◽  
Cancer Center ◽  
Candida Spp ◽  
Logistic Regression Models ◽  
Need To Evaluate ◽  
Clinically Significant ◽  
Antifungal Use

Background: This study aimed to identify the risk factors of candidemia and asses possible clinically significant differences between Candida parapsilosis and other candida species among cancer patients.Methods: A retrospective study was conducted in a Chinese tertiary cancer center over a 6-year period. A total of 323 cancer patients were enrolled and analyzed from 2012 to 2018. Data about demographic characteristics, underlying diseases, and risk factors of candidemia were collected. Univariate and multivariate logistic regression models were used to identify the risk factors associated with the development of candidemia.Results: Among the isolates, the species most frequently isolated was C. parapsilosis (37.15%, 120/323), and C. albicans only accounted for 34.37%. Based on statistical analysis, when candidemia patients who had C. parapsilosis were compared with other Candida spp., the following factors were found to be significantly associated with C. parapsilosis fungemia: parenteral nutrition (p < 0.001), neutropenia (p < 0.001), receipt of chemotherapy (p = 0.002), and previous antifungal use (p < 0.001). Parenteral nutrition was a factor that independently predicted C. parapsilosis candidemia (OR, 0.183; 95% CI, 0.098–0.340; p < 0.001).Conclusions: In short, C. parapsilosis as the leading non-albicans Candida spp. isolates in candidemia is posing a major threat for cancer patients. The study highlights the urgent need to evaluate the possibility of development of C. parapsilosis candidemia in cancer patients exposed to these risk factors effective and prevention strategies against this causative agent transmitted through nosocomial route should be implemented.

Genetic diversity among microsporidian isolates from the silkworm, Bombyx mori, as revealed by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers

2011 ◽  
Vol 56 (4) ◽  
Author(s):  
B. Surendra Nath ◽  
W. Hassan ◽  
S. Nageswara Rao ◽  
N. Vijaya Prakash ◽  
S. Gupta ◽  
...  
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Type Species ◽  
Rapd Markers ◽  
Randomly Amplified Polymorphic Dna ◽  
Chain Reaction ◽  
Rapd Pcr ◽  
Random Amplification ◽  
Major Cluster ◽  
Sources Of Infection ◽  
Polymerase Chain

AbstractRandom amplification of polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD-PCR) was carried out to assess the genetic diversity of five new microsporidian isolates viz., NIWB-11bp, NIWB-12n, NIWB-13md, NIWB-14b and NIWB-15mb identified from the silkworms. A type species, NIK-1s_mys was used as control for comparison. Differences in the spore shape, length and width were observed. Of the 30 decamer random primers tested, 22 primers gave repeatable RAPD profiles and yielded a total of 143 fragments, of which 78 were polymorphic (55%). The resulting data was used to derive genetic similarity values for constructing a dendrogram. The neighbour joining method based on Dice coefficients indicate a major cluster comprising NIK-1s_mys, NIWB-11bp and NIWB-12n, whereas NIWB-13md, NIWB-14b and NIWB-15mb appear to be different from each other as well from the major cluster mentioned above which includes the type species (NIK-1s_mys). Based on the reproducibility of RAPD profiles, we are able to identify these microsporidians as different isolates. The RAPD technique may be useful in detecting sources of infection of this economically important domestic insect.

scholarly journals AVALIAÇÃO DOS MICRORGANISMOS VIÁVEIS POTENCIALMENTE PATOGÊNICOS EM BIOAEROSSÓIS EM UMA UNIDADE DE TERAPIA INTENSIVA

2021 ◽  
Vol 21 (43) ◽  
pp. 256-270
Author(s):  
Tharinne Oliveira Silva Cavalheiro ◽  
Dora Inés Kozusny-Andreani
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Candida Albicans ◽  
Candida Spp ◽  
E Coli ◽  
Terapia Intensiva ◽  
Klebsiella Spp

Bioaerossóis são partículas transportadas pelo ar que se originam de micro-organismos vivos, como bactérias, fungos e vírus e, podem permanecer suspensos e viáveis ​​na corrente de ar por longos períodos de tempo. Seus componentes têm efeitos negativos, especialmente na saúde de pessoas imunocomprometidas. Objetivou-se avaliar a presença de microrganismos viáveis potencialmente patogênicos em bioaerossóis de uma Unidade de Terapia Intensiva de um hospital do noroeste paulista.. Para a pesquisa foram colhidas amostras do ar de locais definidos. Todas as amostras foram cultivadas em Placas de Petri contendo meios seletivos e não seletivos para bactérias e fungos, incubadas à temperatura de 37 ºC por 24-48h para cultivos bacterianos e de 4 a 15 dias para cultivos fúngicos. Posteriormente, foi realizada a avaliação das características das colônias bem como a identificação por métodos bioquímicos convencionas. Os resultados obtidos evidenciaram a presença de leveduras das espécies Candida albicans e Candida spp e bactérias gram-positivas Staphylococcus aureus, S. epidermidis e Micrococcus spp, gram-negativas Escherichia coli e Klebsiella spp.   Verificou-se pradrão de resistência a antibióticos em E. coli e Micrococcus spp, S. aureus foi sensível a maioria dos antibióticos, enquanto foi possível observar 100% de sensibilidades para S. epidermidis e Klebsiella spp.

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