Colonization of fiber-glass plates by benthic diatoms from subtidal sediment off the coast of Yucatan, Mexico

Benthic diatoms thrive in many types of substrata, either natural or alternative such as the surfaces of large and small boats in which colonization by micro- and macro-organisms (fouling) represents an important economic and environmental problem. Addressing this issue is difficult given the scarce information on benthic diatoms one of the main micro-fouling settlers. Thus, this study aimss to describe the colonization process by diatoms on fiber-glass plates and construct a floristic list of the diatom taxa growing both on these surfaces and their likely source the subtidal bottom sediment. The study was conducted at a coastal site off Telchac, Yucatan (Mexico), where fiber-glass plates were laid over the bottom sediment at a depth of 10 m during four months. Sampling was carried out over successive spaced points in time (1st, 3rd, 4th, 8th, 12th and 16th weeks) after the initial immersion of the plates. At the end 88 taxa growing on the plates and sediment were identified, the most abundant ones being Cocconeis scutellum var. parva, Cymatosira lorenziana, Paralia sulcata, Delphineis surirella var. australis, Actinoptychus senarius, Grammatophora marina and Shionodiscus oestrupii. Included were two new records for the Mexican littorals: Cocconeis latestriata and Navicula uniseriata. Overall species composition differs from previous studies in the area, to which forty-seven taxa are added here, increasing their total number to 210. Our results show the changes in the species composition of the taxocenosis over time, during the initial colonization period, i.e., the period during which there is no intense competition for space. The high percentage of common species between the plates and sediment (similarity) support the hypothesis that subtidal sediment is the most likely source for diatoms colonizing the plates.

In memoriam Francisco de Lachica Bonilla

Con su partida el 2 de febrero de 2019, la UNAM perdió al Politécnico más Politécnico de los Pumas, pues siempre consideró al Instituto Politécnico Nacional como su alma mater. Francisco, el de la austeridad republicana, admirador de Juárez, amante de los libros, de la poesía, la tertulia y de las buenas pláticas. Francisco, la persona más ilustrada que conocí y del cual siempre presumí como el biólogo más culto en biología. Te vamos a extrañar.

En memoria Francisco de Lachica Bonilla

Fue un apreciable compañero, colega y amigo de Comunidad. Permaneció en activo hasta el día de su fallecimiento por enfermedad, el 2 de febrero de 2019, en La Paz, B.C.S.

CAPACIDAD DE ADHESIÓN A MOCO DE CORAL DE BACTERIAS AISLADAS DE Pocillopora sp. Y Porites panamensis DEL SUROESTE DEL GOLFO DE CALIFORNIA

El estudio de la microbiota en corales es de fundamental importancia para un mejor entendimiento de los procesos que determinan su asociación con el holobionte, sin embargo, aún se conoce poco acerca de los mecanismos básicos de dicha asociación. En esta investigación el objetivo fue aislar a partir de corales sin signos aparentes de enfermedad, las bacterias predominantes de la comunidad, determinar su capacidad de adhesión al moco producido por Pocillopora sp. e identificarlas molecularmente. Se recolectaron corales de los géneros Pocillopora sp. y P. panamensis, se cuantificó la población de cuatro grupos de microorganismos (expresados como Log de UFC g-1): bacterias mesófilas aerobias (4.7 - 6.4), bacterias ácido lácticas (˂1.0-5.8), bacterias del género Vibrio (˂1.0-4.5), así como hongos y levaduras (˂1.0-3.6). Se aislaron 156 cepas bacterianas del holobionte homogeneizado y se seleccionaron aquellas con mayor crecimiento a las 24 h para el ensayo de adhesión, que consistió en 25 cepas de Pocillopora sp. y 27 de Porites panamensis. El ensayo de adhesión al extracto crudo de moco de Pocillopora sp., marcado enzimáticamente con HRP mostró que el 82 % de las cepas se adhieren. Se extrajo ADN de todas las cepas, sin embargo, con los oligonucleótidos universales utilizados se obtuvieron productos de PCR solo de 32. Se identificaron molecularmente 14 de Pocillopora sp. y 18 de P. panamensis con base en la secuenciación y análisis del gen 16S DNAr. Las cepas identificadas correspondieron a 17 especies, donde predominó el género Bacillus, con 64 % en Pocillopora sp. y 44 % en P. panamensis. Las especies de bacterias que comparten estos corales son B. subtilis y Staphylococcus hominis. Se sugiere que las especies identificadas adherentes tienen la capacidad de colonizar el moco del coral, son comensales y potencialmente benéficas, debido a que fueron aisladas de corales aparentemente sanos. Adhesion ability to coral mucus of isolated bacteria from Pocillopora sp. and Porites panamensis of California Gulf southeast ABSTRACT. The study of coral microbiota is of fundamental importance for a better understanding of the processes that determine its association with the holobiont, however, little is known about the basic mechanisms of this association. In this research, the objective was to isolate from corals without apparent signs of disease, the predominant bacteria of the community, determine their ability to adhere to the mucus produced by Pocillopora sp. and identify them molecularly. Corals of the genera Pocillopora sp. and Porites panamensis were recollected, the population of four groups of microorganisms (expressed as Log of CFU g-1) was quantified. Results indicated aerobic mesophilic bacteria (4.7 - 6.4), lactic acid bacteria (˂1.0-5.8), bacteria of the Vibrio genus (˂ 1.0-4.5), as well as fungi and yeasts (˂1.0-3.6). 156 bacterial strains of the homogenized holobiont were isolated and those with the highest growth at 24 h were selected for the adhesion test, which consisted of 25 strains of Pocillopora sp. and 27 of P. panamensis. The adhesion test to the enzymatically labeled with HRP crude mucus extract of Pocillopora sp., showed that 82% of the strains adhere. DNA was extracted from all strains, however, with the universal oligonucleotides used, only 32 PCR products were obtained. 14 strains from Pocillopora sp. and 18 from P. panamensis were molecularly identified based on the sequencing and analysis of the 16S DNAr gene. The strains identified corresponded to 17 species, where the genus Bacillus predominated, with 64% in Pocillopora sp. and 44% in P. panamensis. The species of bacteria that share these corals are B. subtilis and Staphylococcus hominis. It is suggested that the identified adherent species have the ability to colonize coral mucus, are commensal and potentially beneficial, because they were isolated from apparently healthy corals.

MESOZOOPLANCTON Y VARIACIÓN AMBIENTAL DURANTE EL EVENTO ENOS 2009-2010 EN LA COSTA NORTE DEL ESTUARIO DEL RÍO DE LA PLATA

Se ha demostrado que los eventos climáticos a macro-escala como El Niño-Oscilación Sur (ENOS) ocasionan modificaciones en las condiciones meteorológicas e hidrológicas, promoviendo cambios físico-químicos en la columna de agua y en las comunidades bentónicas y pelágicas de zonas costeras y estuarinas en el Océano Atlántico. El Río de la Plata (RdlP) es uno de los principales estuarios de América del Sur, dónde el evento ENOS es una forzante ambiental a macroescala. Se analizó la composición de especies, abundancia, variación temporal y horizontal del mesozooplancton en la costa norte del RdlP durante el ENOS 2009-2010. Se recolectaron muestras de zooplancton mediante arrastres sub-superficiales en quince estaciones durante once fechas. Se midieron parámetros físico-químicos y biológicos de la columna de agua (temperatura, salinidad, concentración de oxígeno disuelto, turbidez, contenido de clorofila a) y se relacionaron con los caudales del RdlP. El holoplancton estuvo dominado por copépodos estuarinos (Acartia tonsa), cladóceros dulceacuícolas (ej.: Bosmina hagmanni, Ceriodaphnia dubia, Moina sp.) y en el meroplancton las larvas de cirrípedos fueron los organismos más abundantes. La variabilidad temporal se reflejó en diferencias en la abundancia e índices ecológicos entre ambas fases del ENOS. La abundancia de copépodos mostró asociación con los caudales del RdlP, negativos durante la fase El Niño y positivos durante La Niña-Neutral. Durante El Niño (noviembre 2009-abril 2010) se observó una mayor riqueza de cladóceros típicos de agua dulce, ocasionando una heterogeneidad horizontal en la zona de estudio. Durante La Niña-Neutral (septiembre 2010-enero 2011) el zooplancton presentó menor riqueza de especies y estuvo dominado por copépodos típicos del RdlP (Acartia tonsa). Mediante un Análisis de Correspondencia Canónica se determinó que la salinidad, caudal del RdlP y concentración de la clorofila a explicaron el 88.4% de la varianza total de la relación especie-ambiente. El trabajo presenta información inédita sobre la respuesta de organismos zooplanctónicos a eventos climáticos e hidrológicos en el estuario del RdlP. Mesozooplankton and environmental variation during the 2009-2010 ENSO event on the north coast of the Río de la Plata estuaryPrevious studies have demonstrated that macro-scale climatic events such as ENSO, cause changes in meteorological and hydrological conditions, inducing physicochemical changes in the water column, as well as in coastal and estuarine communities in the Atlantic Ocean. Rio de la Plata (RdlP) is the second largest estuary of South America, where ENSO is a macro-scale environmental driving force. In this paper, the species composition, abundance, as well as the temporal and horizontal variation of the mesozooplankton in the north coast of the RdlP during 2009-2010 ENSO were analyzed. Zooplankton samples were collected with sub-surface trawls in fifteen stations during eleven sampling surveys. Physico-chemical parameters of the water column (temperature, salinity, dissolved oxygen, turbidity, and chlorophyll a) were determined and related to the RdlP flows. The holoplankton was dominated by estuarine copepod (Acartia tonsa), freshwater cladocerans (Bosmina hagmanni, Ceriodaphnia dubia, Moina sp.), and in the meroplankton, barnacle larvae were the most abundant group. Temporal variability was reflected in abundance differences and ecological indexes between both ENSO phases. The copepods abundance showed a positive association with RdlP flow during El Niño (Nov 2009-Apr 2010), and negative during La Niña-Neutral (Sep 2010-Jan 2011). During El Niño months, the higher richness of typical freshwater cladocerans was observed, promoting a horizontal heterogeneity in the study area. During La Niña-Neutral, the zooplankton showed lower species richness and was dominated by copepods typical of the RdlP (Acartia tonsa). Canonical Correspondence Analysis showed that salinity, RdlP flow, and chlorophyll a explained 88.4% of the total variance of the species-environment relationships. This paper presents new information on zooplanktonic organisms’ response to climatic and hydrological events in the RdlP estuary.

First record of monoclasper in the Banded guitarfish, Zapteryx exasperata in the Gulf of California, Mexico

Se reporta por primera vez un macho maduro de Zapteryx exasperata con ausencia de clasper derecho, para el Golfo de California. Las observaciones directas en el sistema reproductivo no mostraron anomalías ni evidencia de cicatrización reciente de la aleta pélvica derecha. Se sugiere que esta condición podría generarse por dos posibles causas: malformación congénita o pérdida accidental en una etapa temprana de madurez (por ejemplo, la mordedura de un depredador).

Primary productivity of coccoid cyanobacteria isolated from a coastal lagoon environment south of the Gulf of California.

Productividad primaria de cianobacterias cocoides aisladas de un ambiente lagunar costero al sur del Golfo de CaliforniaRESUMEN. El objetivo de este estudio fue determinar la productividad primaria de cianobacterias cultivadas bajo diferentes fuentes nitrogenadas. Se consideraron 3 tratamientos: 1) sin fuente nitrogenada, 2) con nitrato (NO3), y 3) con amonio (NH4). Se realizaron incubaciones bajo condiciones controladas. Las densidades celulares fueron significativamente mayores en el tratamiento con nitratos. Los máximos de biovolumen (19.9 µm-3) y de contenido de carbono (5.4 pg C cel-1) se observaron en la fase estacionaria del tratamiento con amonio. La mayor concentración de clorofila a en la fase exponencial se registró en el tratamiento sin nitrógeno (1.038 mg m-3), mientras que el máximo en la fase estacionaria en el tratamiento con nitratos (0.65 mg m-3). La mayor producción primaria se registró en la fase exponencial (23.9 mg C m-3 h-1), asociada al tratamiento sin fuente nitrogenada incubado a 150 µ E m-2 s-1; en la fase estacionaria el máximo (11.6 mg C m-3 h-1) se registró en el tratamiento enriquecido con nitratos a 75 µ E m-2 s-1.

INVESTIGATIONS ON MESOPHOTIC CORAL ECOSYSTEMS IN CUBA (1970-1973) AND MEXICO (1983-1984)

After a pioneering study of Jamaican coral reefs, the Cuban archipelago was the second to be surveyed by SCUBA for scleractinian corals and reef life to a depth of 90m, sampling all phenotypes. Regrettably, the published data on the mesophotic coral ecosystems (MCEs) of Cuba, collected 1970 to 1973, have been ignored. This is also true for the published data on the MCEs of the Mexican Yucatán Peninsula, collected 1983 to 1984. These two investigations described immense areas exhibiting a rich continuum of coral life, from shallow reefs into MCEs without scleractinian faunal break, and no depth-specialists species complex. Instead, a morphological changeover of three-dimensional corallum into two-dimensional corallum was observed and documented. The existing data on the Cuban and Mexican MCEs (now 45 and 34 years old, respectively) present a unique opportunity for long-term status and ecosystem trends analysis. MCEs require terminological clarification from collaborative efforts to effectively use the globally available data.Investigaciones sobre ecosistemas coralinos mesofóticos en Cuba (1970-1973) y México (1983-1984)RESUMEN. Después de un estudio pionero en arrecifes de Jamaica sobre corales escleratinios y vida arrecifal, el archipiélago cubano fue el segundo que se estudió mediante buceo SCUBA a profundidades de hasta 90m, incluyendo muestras de todos los fenotipos. Infortunadamente, los datos publicados sobre ecosistemas coralinos mesofóticos (ECM), recabados entre 1970 y 1973 han sido soslayados, al igual que los datos publicados sobre los ECM de la Península de Yucatán, México, recabados entre 1983 y 1984. Ambas investigaciones describen áreas inmensas que exhiben un rico continuo de vida coralina, desde arrecifes someros hasta ECM sin ruptura en la fauna escleratinia y sin complejos de especies especialistas de profundidad. En vez de esto, se observó y documentó un reemplazamiento de formas tridimensionales de corales por formas bidimensionales. La información existente sobre ECM cubanos y mexicanos con antigüedades de 45 y 34 años, respectivamente ofrecen una oportunidad única para realizar análisis sobre estatus a largo plazo y tendencias de ecosistema. Los ECM requieren aclaración terminológica de esfuerzos de colaboración para utilizar efectivamente los datos disponibles globalmente.

EFECTO DEL CLIMA EN LAS PESQUERIAS DE ABULON Y LANGOSTA EN BAJA CALIFORNIA, MEXICO.

Las pesquerías de abulón y langosta en la costa de Baja California entre 1950 y 2011, muestran tendencias opuestas, mientras la captura de abulón desciende, la de langosta es ascendente, siendo parte de un mismo ecosistema, y que ambas pesquerías son explotadas por los mismos pescadores, y considerando que la tendencia de calentamiento del ambiente marino durante el periodo de estudio. Se trata de identificar las variables que han determinado la variación de las capturas, y en el caso de la langosta evaluar la influencia del esfuerzo de pesca. Las variables ambientales se identifican con los índices: ENOS Multivariado (MEI), Oscilación Decadal del Pacífico (DOP), Oscilación Giro del Pacífico Norte (OGPN), y variables locales como el Índice de Surgencias (IS) y la temperatura de la superficie del mar (TSM). El análisis se centra en la variación de largo plazo o baja frecuencia, por lo que los datos son suavizados con ventanas de 5 años. Se examina la variación estacional en dos periodos el cálido y el frío. El análisis de componentes principales identifica el mismo patrón de variación para Los índices MEI, DOP y TSM, por lo que se usa el primer componente como representativo de los tres (F1). La captura de abulón se correlaciona inversamente con el F1, a diferencia del caso de la langosta, a la que parece favorecer la tendencia al calentamiento, pero en este caso el esfuerzo explica mejor la tendencia.

Growth Profiles, Nutrient composition and Pigments Analysis of Dunaliella salina strain San Quintin

Some microalgae are recognized for producing pigments and other metabolites with biotechnological importance, particularly, <i>Dunaliella salina</i> is a remarkable one. These kind of compounds are used as food and have a great industrial potential. The pigment industry comprises a millionaire market value, being β-carotene one of the most profitable one. In this study we describe the morphology, molecular identification, growth dynamics, proximal composition, nutrients and pigment content of a recently isolated <i>Dunaliella salina</i> strain (SQ) under different salinity/light conditions, in order to highlight its remarkable properties for biotech/biomed industry. <i>D. salina</i> SQ reached the highest densities (1.07-1.25 cell mL-1 x106) at low salinities (100-500 mM NaCl) under continuous light regimen (24:0 h Light:Dark). Neoxanthin (Neo) and violaxanthin (Viol) were the most abundant pigments when exposed to 500 mM NaCl (18:6 h Light:Dark). Furthermore, this peculiar strain produces other compounds with high industrial value.Perfiles de crecimiento, composición de nutrientes y análisis de pigmentos de <i>Dunaliella salina</i> cepa San Quintín Algunas microalgas son reconocidas por producir pigmentos y otros metabolitos con importancia biotecnológica, en particular, <i>Dunaliella salina</i> es una de las más notables. Este tipo de compuestos se usan como alimento y tienen potencial industrial. La industria del pigmento tiene un valor de mercado millonario, siendo el β-caroteno uno de los más rentables. En este estudio se describe la morfología, la dinámica de crecimiento, composición proximal, composición de nutrientes y contenido de pigmentos de una cepa de <i>Dunaliella salina</i> (SQ) recientemente aislada. La identificación de la especie se corroboró mediante técnicas moleculares. Se cultivó a <i>D. salina</i> bajo diferentes condiciones de salinidad y luz, con el objetivo de resaltar sus propiedades para la industria biotecnológica y biomédica. <i>D. salina</i> SQ alcanzó las densidades más altas (1.07-1.25 células mL-1 x106) a salinidades bajas (NaCl 100 y 500 mM) en un régimen de luz continua. La neoxantina (Neo) y la violaxantina (Viol) fueron los pigmentos más abundantes en 500 mM NaCl y un ciclo de luz: oscuridad 18: 6 h. Además, esta peculiar cepa produce otros compuestos con alto valor industrial.