RESEARCH OF THE MICROBIOM OF THE GASTROINTESTINAL TRACT OF THE ABERDIN-ANGUS BREED CATTLE

Целью исследования было определение таксономической структуры микробиома кишечника крупного рогатого скота породы Абердин-Ангус с помощью технологии секвенирования нового поколения. 16S метагеномный анализ, позволил определить микробный состав содержимого кишечника, минуя стадию культивирования на питательных средах. Проведена генетическая идентификация и получен таксономический профиль всех присутствующих бактерий, в том числе и некультивируемых форм. The aim of the study was to determine the taxonomic structure of the intestinal microbiome of Aberdeen Angus cattle using a new generation sequencing technology. 16S metagenomic analysis made it possible to determine the microbial composition of the intestinal contents bypassing the stage of cultivation on nutrient media. Genetic identification was carried out and a taxonomic profile of all bacteria present, including non-cultivated forms, was obtained. Key words: microbiome, cattle, Aberdeen Angus, next generation sequencing.

STUDY OF THE BIOCOMPATIBILITY OF MUTANT STRAINS OF ROOT NODULE AND PGPR BACTERIA, PROMISING AS A BASIS OF MICROBIAL PREPARATIONS

В статье приведены результаты исследования биосовместимости мутантных штаммов клубеньковых и PGPR бактерий (ризобактерий) с целью их совместного применения для культур маша и фасоли. По результатам проведенных исследований определены штаммы, проявившие контактную прогрессию и нейтралитет - Pseudomonas putidaМ-1 и Phyllobacterium sp. 35М; штаммы Bacillus subtilis М-2 и Chryseobacterium rhizoplanae 1М оказались наиболее перспективными в отношении совместного культивирования.Таким образом, подобраны консорциумы на основе мутантных штаммов азотфиксирующих и ростостимулирующих бактерий Pseudomonas putida М-1 и Chryseobacterium rhizoplanae для растений маша и Bacillus subtilis М-2 и Phyllobacterium sp. 35М - для растений фасоли. Полученные результаты открывают возможность комбинирования мутантных штаммов PGPR с ростостимулирующей активностью (Pseudomonas putida М-1, Bacillus subtilis М-2) и клубеньковыхбактерий (Phyllobacterium sp. 35М, Chryseobacterium rhizoplanae) с азотфиксирующей активностью с целью получения на их основе биопрепарата с сочетанными свойствами. The article presents the results of a study of the biocompatibility of mutant strains of nodule and PGPR bacteria with the aim of their combined use for mung bean and beans. According to the results of the studies, the strains that showed contact progression and neutrality were identified - Pseudomonas putida M-1 and Phyllobacterium sp. 35M; strains Bacillus subtilis M-2 and Chryseobacterium rhizoplanae 1M proved to be the most promising for co-cultivation. Thus, consortia were selected based on mutant strains of nitrogen-fixing and growth-stimulating bacteria Pseudomonas putida M-1 and Chryseobacterium rhizoplanae for mung bean and Bacillus subtilis M-2 and Phyllobacterium sp.35M for bean plants. The results obtained open up the possibility of combining mutant PGPR strains with growth-stimulating activity (Pseudomonas putida M-1, Bacillus subtilis M-2) and nodule bacteria with nitrogen-fixing activity (Phyllobacterium sp. 35M, Chryseobacterium rhizoplanae) in order to obtain a biological product with combined properties on their basis.

STUDY OF THE ANTAGONISTIC ACTIVITY OF LACTIC ACID BACTERIA AGAINST ESCHERICHIA COLI (E.COLI)

В современное рыночное время наряду с производством чистых молочных продуктов встречаются производства, производящие продукцию с добавлением в ее состав бесполезных добавок. Поэтому одним из важных вопросов является изучение качественных показателей существующих продуктов в производстве молочных напитков, в том числе, на рынке. Известно, что к качественным определяющим факторам молочных напитков относятся такие показатели, как содержание витаминов, углеводов, белков, жиров и кислотность.Кроме того, проявлением кисломолочными бактериями антагонистических свойств, особенно к штамму Escherichia coli, определяет их важную роль в организме. In modern market times, along with the production of pure dairy products, there are industries that produce products with the addition of useless additives to its composition. Therefore, one of the important issues is to study the quality indicators of existing products in the production of dairy beverages, including ones on the market. It is known that the qualitative determinants of milk drinks include such indicators as the content of vitamins, carbohydrates, proteins, fats and acidity. Also, the manifestation of antagonistic properties in fermented milk bacteria, especially against Escherichia coli strain, determines their important role in the body.

MICROBIOLOGICAL ASPECTS OF GROWING MUSHROOMS

Рост численности населения земного шара, истощение природных ресурсов и связанная с этим нехватка продовольствия ставят вопрос о необходимости переработки производимых растительных отходов с целью защиты окружающей среды и получения альтернативных источников пищи. Использование целлюлозосодержащих пожнивных остатков для производства высших грибов является оптимальным решением указанных проблем. Высокая пищевая и лекарственная ценность высших грибов доказана многочисленными исследованиями. Однако процессы культивирования высших грибов сталкиваются с проблемой селективности субстрата, сдерживающей рост этой отрасли производства. К настоящему времени накапливаются данные о взаимодействии высших грибов и микроорганизмов, которое открывает возможности управляемого культивирования и направленного биосинтеза практически ценных метаболитов высших грибов. Статья посвящена различным аспектам воздействия микроорганизмов на процесс выращивания высших грибов. The growing population of the world, the depletion of natural resources and the associated food shortage raise the question of recycling the plant waste produced to protect the environment and obtain alternative food sources. The use of cellulose-containing crop residues for the production of mushrooms is the optimal solution to these problems. The high nutritional and medicinal value of mushrooms has been proven by numerous studies. However, the processes of cultivation of higher fungi are faced with the problem of substrate selectivity, which inhibits the growth of this industry. To date, data are accumulating on the interaction of higher fungi and microorganisms, which opens up possibilities for controlled cultivation and directed biosynthesis of practically valuable metabolites of higher fungi. The article is devoted to various aspects of the influence of microorganisms on the process of growing mushrooms.

INFLUENZA A AND B VIRUSES CIRCULATING IN THE TERRITORY OF SOUTHERN KAZAKHSTAN DURING 2020-2021 EPIDEMIC PERIOD

В статье показаны результаты мониторинга циркуляции разных серотипов вируса гриппа на территории южного Казахстана в эпидемический период 2020-2021 гг. С этой целью в период с декабря 2020 г. по февраль 2021 г. в лечебных учреждениях различных регионов южного Казахстана от больных людей получено 370 носоглоточных смывов. При скрининге образцов в полимеразной цепной реакции в режиме реального времени обнаружен генетический материал как вируса гриппа А (8,11% случаев), так и вируса гриппа В (5,14%). При субтипировании образцов, положительных на грипп типа А, РНК вируса гриппа A/H1N1/pdm выявлена в 2,97% проб, A/H3N2 – в 3,51%. В результате последовательных пассажей биопроб на куриных эмбрионах выделено три гемагглютинирующих агента, идентифицированных в реакции торможения гемагглютинации и реакции ингибиции нейраминидазной активности как вирусы гриппа А/H1N1pdm, А/H3N2 и типа В. This paper demonstrates the results of monitoring the circulation of different serotypes of influenza virus in the territory of the southern Kazakhstan during the 2020-2021 epidemic period. For this purpose, 370 nasopharyngeal swabs were obtained from patients in healthcare facilities located in various regions of the southern Kazakhstan during the period from December 2020 to February 2021. Screening of samples in real-time polymerase chain reaction has revealed genetic material of both influenza A virus (8.11% of cases) and influenza B virus (5.14%). When subtyping samples positive for influenza type A, the influenza A/H1N1/pdm virus RNA have been detected in 2.97% of samples, while that from the A/H3N2 virus in 3.51%. As a result of successive passages of biosamples in chicken embryos, three hemagglutinating agents have been isolated and identified in the hemagglutination inhibition assay and the neuraminidase inhibition assay as influenza A/H1N1pdm, A/H3N2, and type B viruses.

STUDYING THE EFFECTIVENESS OF A PROBIOTIC INTENDED AGAINST BRUCELLOSIS IN THE PREVENTION AND TREATMENT OF COLIBACTERIOSIS, SALMONELLOSIS AND PASTERELLOSIS IN EXPERIMENT ON WHITE MICE

Отобрана ассоциация из молочнокислых бактерий Lactobacillus plantarum14д/19+Lactobacillus plantarum 14д/87+Lactobacillus brevis Б-3/43 для лечения и профилактики бруцеллеза, обладающая устойчивостью к используемым антибиотикам, высокой антагонистической активностью к возбудителям бруцеллеза и кишечных инфекций. Установлено, что применение пробиотика c профилактической и лечебной целью значительно снижает индекс инфицированности и интенсивность обсемененности внутренних органов мышей, экспериментально зараженных высоковирулентным штаммом бруцелл B. melitensis 16M. Целью настоящих исследований было изучение на экспериментально зараженных белых мышах лечебно-профилактической эффективности разработанного пробиотика в отношении кишечных инфекций (колибактериоз, сальмонеллез) и геморрагической септицемии (пастереллёз). В результате проведенных исследований установлена высокая профилактическая и терапевтическая эффективность пробиотика как в сочетании с антибиотиком, так и без него, по отношению к возбудителям кишечных инфекций и пастереллёза. Это позволяет рекомендовать пробиотик для профилактики и эффективного лечения кишечных и острых септических инфекций у сельскохозяйственных животных. Применение пробиотика в ветеринарной практике позволит повысить резистентность организма животных, снизить заболеваемость молодняка кишечными и респираторными инфекционными болезнями, улучшить экологическую ситуацию в хозяйстве вследствие кратковременного выделения микроорганизмов во внешнюю среду, предотвратить заражение здоровых животных и обсемененность окружающей среды. Использование пробиотика для профилактики и лечения инфекционных заболеваний сельскохозяйственных животных снизит их лечение антибиотиками, что позволит предотвратить формирование субклинических, латентных форм инфекции и бактерионосительства. An association of lactic acid bacteria Lactobacillus plantarum 14d / 19 + Lactobacillus plantarum 14d / 87 + Lactobacillus brevis B-3/43 was selected for the treatment and prevention of brucellosis, which is resistant to the antibiotics used, with high antagonistic activity against pathogens of brucellosis and intestinal infections. It has been established that the use of a probiotic for prophylactic and therapeutic purposes significantly reduces the infection index and the intensity of contamination of the internal organs of mice experimentally infected with a highly virulent strain of brucella B. melitensis 16M. The aim of these studies was to study the therapeutic and prophylactic efficacy of the developed probiotic against intestinal infections (colibacillosis, salmonellosis) and hemorrhagic septicemia (pasteurellosis) on experimentally infected white mice. As a result of the studies, a high prophylactic and therapeutic efficacy of the probiotic was established both in combination with an antibiotic and without it in relation to causative agents of intestinal infections and pasteurellosis. This allows us to recommend a probiotic for the prevention and effective treatment of intestinal and acute septic infections in farm animals. The use of a probiotic in veterinary practice will increase the resistance of the animal body, reduce the incidence of intestinal and respiratory infectious diseases in young animals, improve the ecological situation in the farm due to the short-term release of microorganisms into the external environment, and prevent contamination of healthy animals and contamination of the environment. The use of a probiotic for the prevention and treatment of infectious diseases of will reduce the treatment of animals with antibiotics, which will prevent the formation of subclinical, latent forms of infection and bacterial carriage.

CHARACTERISTICS OF THE MICROBIOME OF THE MAIN BIOTOPES OF THE CASPIAN SEAL

В статье приведены результаты метабаркодирования ДНК микробиома респираторного, урогенитального и желудочно-кишечного трактов каспийского тюленя. Показан профиль микробиома каспийского тюленя и отмечено отсутствие возбудителей бактериальных зоонозов в их бета-сообществе микробиотов. The article presents the results of metabarcoding of the microbiome DNA of the respiratory, urogenital and gastrointestinal tracts of the Caspian seal. The microbiome profile of the Caspian seal is shown, and the absence of pathogens of bacterial zoonoses in their beta microbiota community is noted. Key words: Caspian seal, metagenome, microbiome, sequencing.

МОЛОЧНОКИСЛЫЕ БАКТЕРИИ ПРОТИВ АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНЫХ ПАТОГЕНОВ

Antibiotic resistance of microorganisms is one of the greatest challenges of the 21st century. Many of the previously effective antibiotics are no longer applicable due to the widespread prevalence of resistant microbial strains. The ubiquity of resistant organisms is revealed in a number of articles. Bacterial resistance to antibiotics is very actively researched, measured and monitored at the epidemiological level. Particular attention is paid to the study of the antimicrobial properties of lactic acid bacteria, since they have various advantages as a means of combating antibiotic-resistant pathogens. Устойчивость микроорганизмов к антибиотикам - одна из самых серьезных проблем XXI века. Многие из ранее эффективных антибиотиков больше не применимы из-за широкого распространения штаммов резистентных микробов. Вездесущность устойчивых организмов раскрывается в ряде статей. Устойчивость бактерий к антибиотикам очень активно исследуется, измеряется и отслеживается на эпидемиологическом уровне. Особенное внимание уделяется исследованию антимикробных свойств молочнокислых бактерий, так как они обладают различными преимуществами в качестве средств борьбы с антибиотикорезистентнымы патогенами.