scholarly journals Caracterización molecular de genes de resistencia a β-lactámicos en aislados bacterianos clínicos de la familia Enterobacteriaceae

2021 ◽  
Vol 42 (1) ◽  
Author(s):  
María Fernanda Yauri Bucheli
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
El Sistema ◽  
Vitek 2

Las infecciones desarrolladas por enterobacterias productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) se relacionan a altas tasas de mortalidad y morbilidad en ambientes hospitalarios debido a su capacidad de hidrolizar antibióticos β-lactámicos. El objetivo de este estudio fue caracterizar los genes que confieren resistencia a β-lactámicos en enterobacterias obtenidas de un hospital de tercer nivel de la ciudad de Quito.  Se colectaron 153 enterobacterias y se identificó la especie con pruebas bioquímicas. El estudio seleccionó los aislados que presentaron producción de enzimas BLEE analizado por el método de sinergia de doble disco y el sistema automatizado VITEK 2 proporcionado por el centro hospitalario. De los 22 aislados seleccionados, 19 fueron identificados como Escherichia coli y 3 como Klebsiella oxytoca. La capacidad de los aislados de producir enzimas carbapanemasas se determinó con Triton Hodge Test (THT), demostrando que ningún aislado tenía esta capacidad. La identificación de genes de resistencia empleó reacción en cadena de la polimerasa y usó cebadores específicos de cada gen codificante de BLEE (blaCTX-M, blaTEM, blaSHV) y de enzimas carbapenemasas (blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM). La identificación de la variante alélica reportó que 11/22 aislados presentaron el gen blaCTX-M-15 y 4/22 el gen blaTEM-1. Ninguno aislado presentó genes de resistencia a carbapenems.   PALABRAS CLAVES: β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), enterobacterias, genes de resistencia, resistencia bacteriana, variante alélica.

Антимікробна резистентність провідних збудників інфекцій сечових шляхів у Києві (Україна)

2017 ◽  
Vol 1 (2) ◽  
pp. 48-60
Author(s):  
A.G. Salmanov ◽  
A.V. Rudenko
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Staphylococcus Epidermidis ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Enterobacter Aerogenes ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Proteus Vulgaris ◽  
Providencia Rettgeri ◽  
E Coli

Мета роботи — вивчити резистентність до антибіотиків бактеріальних збудників інфекцій сечових шляхів (ІСШ), виділених у пацієнтів урологічного стаціонару в м. Києві. Матеріали і методи. Досліджено 1612 штамів бактерій, виділених із сечі хворих з ІСШ (цистит, уретрит, пієлонефрит), госпіталізованих в урологічне відділення ДУ «Інститут урології НАМН України» у м. Києві протягом 2016 р. Серед пацієнтів переважали жінки — 1201 (74,5 %). Вік хворих становив від 17 до 74 років. Для збору даних використано медичну документацію лікарні. Мікробіологічні дослідження виконано у лабораторії мікробіології ДУ «Інститут урології НАМН України». Аналізували результати культурального дослідження зразків сечі, зібраних за наявності клінічних ознак ІСШ. Дослідження клінічного матеріалу та інтерпретацію отриманих результатів проводили загальноприйнятими методами. Вивчено чутливість уропатогенів до 31 антибіотика дискодифузійним методом відповідно до рекомендацій Інституту клінічних та лабораторних стандартів США (Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)). Результати та обговорення. Аналіз мікробного спектра сечі виявив домінування серед уропатогенів штамів Escherichia coli (32,0 %), Enterococcus faecalis (19,5 %), Klebsiella pneumoniae (10,9 %), Staphylococcus epidermidis (8,9 %), S. haemolyticus (6,5 %) та Pseudomonas aeruginosa (6,4 %). Частка Enterococcus faecium, Enterobacter aerogenes і Streptococcus viridans становила відповідно 2,5, 2,2 і 1,6 %, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris та Providencia rettgeri — менше 1,0 %. У більшості випадків (69,7 %) мікроорганізми виділено у монокультурі, у решті випадків — у мікробних асоціа- ціях. Високу резистентність до тестованих антибіотиків виявили штами E. aerogenes (45,1 %), E. cloacae (45,7 %), E. faecium (40,9 %), E. faecalis (40,7 %), E. coli (39,9 %), P. aeruginosa (34,0 %), K. pneumoniae (28,6 %). Найбільш активними до уропатогенів були іміпенем (E. coli — 87,6 %, P. aeruginosa — 75,7 %, E. cloacae — 67,3 %, E. aerogenes — 72,6 %, K. pneumoniae — 93,2 %), меропенем (E. coli — 89,1 %, P. aeruginosa — 76,7 %, K. pneumoniae — 82,6 %), лефлоцин (E. coli — 74,5 %, ентерококи — 78,7 %, P. aeruginosa — 76,7 %, E. cloacae — 73,9 %, E. aerogenes — 80,4 %, K. pneumoniae — 83,5 %), амоксицилін/клавуланат (ентерококи — 84,6 %), фурагін (ентерококи — 82,6 %), цефоперазон (K. pneumoniae — 89,2 %, P. aeruginosa — 73,8 %), цефтріаксон (K. pneumoniae — 80,1 %). Висновки. Антибіотикорезистентність збудників ІСШ — важлива терапевтична проблема. Найбільшою активністю до уропатогенів характеризуються іміпенем, меропенем, лефлоцин, амоксицилін/ клавуланат, фурагін, цефоперазон, цефтріаксон, які можна розглядати як препарат вибору для призначення стартової терапії ІСШ. Необхідно здійснювати постійний моніторинг за резистентністю до дії антибіотиків. Політику використання антибіотиків у кожному стаціонарі слід визначати залежно від локальних даних щодо резистентності до протимікробних препаратів.

PuIO, a component of the pullulanase secretion pathway of Klebsiella oxytoca, correctly and efficiently processes gonococcal type IV prepilin in Escherichia coli

1992 ◽  
Vol 6 (14) ◽  
pp. 1887-1894 ◽  
Author(s):  
Bruno Dupuy ◽  
Muhamed-Kheir Taha ◽  
Odile Possot ◽  
Christian Marchal ◽  
Anthony P. Pugsley
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Secretion Pathway ◽  
Type Iv

scholarly journals Diagnóstico de indicadores entéricos en cilantro (Coriandrum sativum) y perejil (Petroselinum sativum) que se expenden en mercados populares del norte de la ciudad de Quito

Enfoque UTE ◽  
2015 ◽  
Vol 6 (1) ◽  
pp. 45-54
Author(s):  
Dayana Cerón Salgado ◽  
Nubia Grijalva
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Coriandrum Sativum ◽  
El Sistema

(Recibido: 2015/01/20 - Aceptado: 2015/03/25)Se analizaron 108 muestras (54 de cilantro y 54 de perejil) obtenidas de manera aleatoria en tres puestos de expendio de tres mercados del norte de la ciudad de Quito seleccionados para este estudio. Se realizó la determinación de Coliformes Totales (CT), Coliformes Fecales (CF) y Escherichia coli (EC). La población de CT para cilantro fue de 5.09 log UFC/g y 6.39 log UFC/g para perejil. Se obtuvieron valores de CF de 607.0 NMP/g en el mercado uno, 596.7 log NMP/g en el mercado dos y 474.2 NMP/g para el mercado tres. El 23.1% de las muestras de perejil presentaron recuentos positivos para Escherichia coli mientras que para cilantro el 14.8% de las muestras fueron positivas. La presencia de indicadores entéricos (CT, CF y EC) fue independiente del mercado y puesto de expendio lo que indica un alto nivel de contaminación y demuestra la necesidad de un control microbiológico en el sistema de riego, cosecha, transporte y condiciones higiénicas de los manipuladores para asegurar la calidad de los vegetales tipo hoja, es recomendable establecer una normativa local para evaluar la calidad microbiológica de este tipo de alimentos.

scholarly journals Multi-omic surveillance of Escherichia coli and Klebsiella spp. in hospital sink drains and patients

2020 ◽  
Author(s):  
B Constantinides ◽  
KK Chau ◽  
TP Quan ◽  
G Rodger ◽  
M Andersson ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Antimicrobial Resistance ◽  
Resistance Genes ◽  
Bacterial Infections ◽  
Wide Spectrum ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Clinical Disease ◽  
E Coli ◽  
Antimicrobial Resistance Genes ◽  
Wide Range

ABSTRACTEscherichia coli and Klebsiella spp. are important human pathogens that cause a wide spectrum of clinical disease. In healthcare settings, sinks and other wastewater sites have been shown to be reservoirs of antimicrobial-resistant E. coli and Klebsiella spp., particularly in the context of outbreaks of resistant strains amongst patients. Without focusing exclusively on resistance markers or a clinical outbreak, we demonstrate that many hospital sink drains are abundantly and persistently colonised with diverse populations of E. coli, Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca, including both antimicrobial-resistant and susceptible strains. Using whole genome sequencing (WGS) of 439 isolates, we show that environmental bacterial populations are largely structured by ward and sink, with only a handful of lineages, such as E. coli ST635, being widely distributed, suggesting different prevailing ecologies which may vary as a result of different inputs and selection pressures. WGS of 46 contemporaneous patient isolates identified one (2%; 95% CI 0.05-11%) E. coli urine infection-associated isolate with high similarity to a prior sink isolate, suggesting that sinks may contribute to up to 10% of infections caused by these organisms in patients on the ward over the same timeframe. Using metagenomics from 20 sink-timepoints, we show that sinks also harbour many clinically relevant antimicrobial resistance genes including blaCTX-M, blaSHV and mcr, and may act as niches for the exchange and amplification of these genes. Our study reinforces the potential role of sinks in contributing to Enterobacterales infection and antimicrobial resistance in hospital patients, something that could be amenable to intervention.IMPORTANCEEscherichia coli and Klebsiella spp. cause a wide range of bacterial infections, including bloodstream, urine and lung infections. Previous studies have shown that sink drains in hospitals may be part of transmission chains in outbreaks of antimicrobial-resistant E. coli and Klebsiella spp., leading to colonisation and clinical disease in patients. We show that even in non-outbreak settings, contamination of sink drains by these bacteria is common across hospital wards, and that many antimicrobial resistance genes can be found and potentially exchanged in these sink drain sites. Our findings demonstrate that the colonisation of handwashing sink drains by these bacteria in hospitals is likely contributing to some infections in patients, and that additional work is needed to further quantify this risk, and to consider appropriate mitigating interventions.

scholarly journals Construcción y adecuación de un pasteurizador solar de aguas lluvias para el suministro de agua potable en la vereda Vega Grande, Alpujarra, Tolima

2013 ◽  
Vol 8 (15) ◽  
pp. 7-16
Author(s):  
Freddy Leonard Alfonso Moreno ◽  
Yuri Carolina Salinas Trujillo ◽  
Nury Jizeth Jiménez Macias ◽  
Héctor Medina Pastrana
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
El Sistema

En Colombia muchas poblaciones se encuentran en sectores aislados, lo cual imposibilita la  construcción de una planta de tratamiento de agua, optando por soluciones rudimentarias, lo  que soluciona su problema de abastecimiento, pero pone en riesgo su salud, ya que el agua  recolectada presenta múltiples microorganismos que pueden provocar serias enfermedades.  En este artículo se busca dar a conocer una solución a este problema, en donde el sistema  de horno pasteurizador solar acoplado a un filtro purificador de arena se utilizó para el  tratamiento fisicoquímico y microbiológico de las aguas lluvias para el abastecimiento de agua  apta para consumo humano, encontrando que se mejoraban las propiedades fisicoquímicas del  agua respecto al pH, alcalinidad, dureza, calcio, magnesio, turbidez, hierro y microbiológicas  como la eliminación de las colonias de coliformes totales y escherichia coli. 

scholarly journals Detection of the extended spectrum β-lactamase produced by Escherichia coli from dairy cows by using the Vitek-2 method in Tulungagung regency, Indonesia

2020 ◽  
Vol 34 (1) ◽  
pp. 203-207
Author(s):  
Akyun R. Putra ◽  
Mustofa H. Effendi ◽  
Setiawan Koesdarto ◽  
Suwarno Suwarno ◽  
Wiwiek Tyasningsih ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Dairy Cows ◽  
Extended Spectrum ◽  
Vitek 2

scholarly journals Microbiology of brewing production - bacteria of the order Enterobacterales and culture methods for their detection

2020 ◽  
Vol 66 (5) ◽  
pp. 345-350
Author(s):  
Petra Kubizniaková ◽  
Martina Brožová ◽  
Kateřina Štulíková ◽  
Eva Vontrobová ◽  
Katarína Hanzalíková ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Serratia Marcescens ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Citrobacter Freundii ◽  
Culture Methods ◽  
Aerobic Conditions ◽  
Rahnella Aquatilis ◽  
Raoultella Terrigena ◽  
Incubation Temperatures

The growth of 7 strains belonging to the order of Enterobacterales, represented by the species of Citrobacter Freundii, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Obesumbacterium proteus, Rahnella aquatilis, Raoultella terrigena, Serratia marcescens and Shimwellia pseudoproteus, was monitored on selected cultivation media. Three types of agars - Endo, MacConkey and Chromocult Coliform agar together with two incubation temperatures of 28 and 37 °C were tested under aerobic conditions. The aim of the study was to detect such essential enterobacteria harmful to beer that cannot be proven at 37 °C, which is the temperature usually used in operational laboratories in breweries. Our results showed that most of the tested strains of enterobacteria were able to grow at 28 °C on all selected types of agar. The exception was just the representatives detection of which is problematic at 37 °C. Nevertheless, a little or no growth was always observed on just one of the tested media.

scholarly journals Cloacal enterobacteria isolated from captive roadside hawks (Rupornis magnirostris, GMELIN, 1788) and their antimicrobial susceptibility profile

2016 ◽  
Vol 53 (2) ◽  
pp. 207 ◽  
Author(s):  
Ewerton Fylipe De Araújo Silva ◽  
Joanna Francyne Silva de Barros ◽  
Kleber Botelho Fraga ◽  
Carolina Peixoto Magalhães ◽  
José Eduardo Garcia ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Antimicrobial Susceptibility ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Macconkey Agar ◽  
Salmonella Spp ◽  
Antimicrobial Susceptibility Profile

O conhecimento das enterobactérias presentes em Gavião-carijó pode trazer uma compreensão sobre as doenças infecciosas que podem acometer essa ave, como também outros animais e/ou humanos, além de trazer mais informações sobre essa espécie de grande importância ecológica. Desta forma, o objetivo do estudo foi determinar as enterobactérias presentes na cloaca de Gaviões-carijós cativos e seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianos. Inicialmente, foram coletadas amostras cloacais de nove espécimes com o auxílio de swabs. As amostras foram plaqueadas em ágar MacConkey, ágar Hektoen, ágar EMB e ágar SS e incubadas por 24 h a 35°C. Após incubação, as colônias foram submetidas às provas bioquímicas para confirmação da presença de enterobactérias. Posteriormente, o perfil de susceptibilidade das bactérias frente a agentes antimicrobianos foi avaliado através do teste da difusão em disco de acordo com o Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Escherichia coli (77,8%), Klebsiella oxytoca (11,1%), Klebsiella pneumoniae (11,1%) e Salmonella spp. (55,6%) foram isoladas das amostras coletadas. Dentre as cepas isoladas, algumas apresentaram resistência a até três antimicrobianos. O presente estudo trouxe um maior conhecimento sobre as enterobactérias presentes no Gavião-carijó (Rupornis magnirostris), mostrando um percentual significativo de enterobactérias de importância na saúde pública, evidenciando também a ocorrência de cepas com perfil de resistência a agentes antimicrobianos.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document