Comparison of β-Glucanases Bacillus pumilus, Paenibacillus polymyxa, Bacillus subtilis and Bacillus amyloliquefaciens in Expression System of Pichia pastoris: Biochemical Characteristics and Potential in Fodder Production

2018 ◽  
Vol 34 (6) ◽  
pp. 12-21
Author(s):  
L.N. Borshchevskaya ◽  
◽  
T.L. Gordeeva ◽  
A.N. Kalinina ◽  
S.P. Sineoky ◽  
...  
2016 ◽  
Author(s):  
Ryan J. Morris ◽  
Marieke Schor ◽  
Rachel M.C. Gillespie ◽  
Ana Sofia Ferreira ◽  
Keith M. Bromley ◽  
...  

AbstractBslA is a protein secreted by Bacillus subtilis which forms a hydrophobic film that coats the biofilm surface and renders it water-repellent. We have characterised three orthologues of BslA from Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus licheniformis and Bacillus pumilus as well as a paralogue from B. subtilis called YweA. We find that the three orthologous proteins can substitute for BslA in B. subtilis and confer a degree of protection, whereas YweA cannot. The degree to which the proteins functionally substitute for native BslA correlates with their in vitro biophysical properties. Our results demonstrate the use of naturally-evolved variants to provide a framework for teasing out the molecular basis of interfacial self-assembly.


2020 ◽  
Vol 49 (3) ◽  
pp. 451-457
Author(s):  
Md Abdul Karim ◽  
Rehena Nasrin Happy

Selected bacterial isolates from the surface water of Buriganga river were characterized by morphological, biochemical characteristics and sequence-based PCR-amplified fragments of 16S rRNA. All isolates were rod shaped and Gram-positive. The isolates were confirmed as Chryseobacterium arthrosphaerae strain FDAARGOS 519, Bacillus cabrialesii strain TE 3, Bacillus tequilensis KCTC strain 13622(T), Bacillus amyloliquefaciens DSM 7 strain ATCC 23350, Bacillus subtilis strain E20 and Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 168 based on sequence analysis. A phylogenetic tree was constructed that showed only one major cluster comprising of two sub-clusters grouping Chryseobacterium arthrosphaerae in one and Bacillus tequilensis in another. Chryseobacterium arthrosphaerae strain FDAARGOS 519 was susceptible to all antibiotics at different ranges, while Bacillus tequilensis KCTC strain 13622(T) and Bacillus amyloliquefaciens DSM 7 strain ATCC 23350 were found to be resistant to polymyxin only but sensitive to other antibiotics. However, Bacillus cabrialesii strain TE 3 was resistant to polymyxin and neomycin, while Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 168 was resistant to polymyxin, vancomycin and rifampicin.


2021 ◽  
Vol 2 (2) ◽  
pp. e21109
Author(s):  
Luana Patrícia Pinto Korber ◽  
Ângelo Henrique Canan Korber ◽  
Luciana Grange ◽  
Celestina Alflen Klahold

O objetivo deste trabalho foi verificar o potencial uso de produtos biológicos comerciais na coinoculação com Bradyrhizobium japonicum no tratamento de semente da soja. O experimento foi realizado em papel germitest e o cultivo em vasos. Foram realizados sete tratamentos com cinco repetições, sendo: T1 – testemunha, T2 –Bradyrhizobium japonicum, T3 – B. japonicum + Azospirillum brasilense, T4 – B. japonicum + Bacillus subtilis, T5 – B. japonicum + Bacillus amyloliquefaciens, T6 – B. japonicum + Bacillus methylotrophicus e T7 – B. japonicum + Bacillus pumilus. As variáveis analisadas foram germinação (G), germinação de plântulas normais (GN), índice de velocidade de emergência (IVE), crescimento parte aérea em vaso (CAV) e papel germitest (CAG), de raíz em vaso (CRV) e papel germitest (CRG). Os dados foram submetidos a análise dos pressupostos e determinados a partir do teste de Tukey a 5% de probabilidade e realização da análise de componentes principais (ACP). A coinoculação de B. japonicum + A. brasilense promoveu ganhos de enraizamento e germinação em plântulas de soja. A coinoculação com B. pumilus apresentou potencial de efeito semelhante a associação de B. japonicum + A. brasilense. A associação com B. methylotrophicus apresentou melhor enraizamento em vaso (CRV) que os demais tratamentos. O uso de BPCP’s em associação com B. japonicum potencializa o desenvolvimento inicial da plântula.


Author(s):  
Rafid A. Abdulkareem

The main goal of the current study was cloning and expression of the human insulin gene in Pichia pastoris expression system, using genetic engineering techniques and its treatment application. Total RNA was purified from fresh normal human pancreatic tissue. RNA of good quality was chosen to obtain a first single strand cDNA. Human preproinsulin gene was amplified from cDNA strand, by using two sets of specific primers contain EcoR1 and Notl restriction sites. The amplified preproinsulin gene fragment was double digested with EcoRI and Not 1 restriction enzymes, then inserted into pPIC9K expression vector. The new pPIC9K-hpi constructive expression vector was transformed by the heat-shock method into the E.coli DH5α competent cells. pPic9k –hpi, which was propagated in the positive transformant E. coli cells, was isolated from cells and then linearised by restriction enzyme SalI, then transformed into Pichia pastoris GS115 using electroporation method. Genomic DNA of His+ transformants cell was extracted and used as a template for PCR analysis. The results showed, that the pPic9k – hpi was successfully integrated into the P. pastoris genome, for selected His+ transformants clones on the anticipated band at 330 bp, which is corresponded to the theoretical molecular size of the human insulin gene. To follow the insulin expression in transformans, Tricine–SDS gel electrophoresis and Western blot analysis were conducted. The results showed a successful expression of recombinant protein was detected by the presence of a single major band with about (5.8 KDa) on the gel. These bands correspond well with the size of human insulin with the theoretical molecular weight (5.8 KDa).


Author(s):  
Nguyễn Thị Bích Đào ◽  
Trần Quang Khánh Vân ◽  
Nguyễn Văn Khanh ◽  
Nguyễn Quang Linh

Khi tình hình bệnh hội chứng tôm chết sớm (EMS) đã gây thiệt hại vô cùng to lớn đối với Nuôi trồng thủy sản thì các giải pháp được đề nghị và áp dụng nhằm hạn chế dịch bệnh. Trong đó, việc tìm hiểu và đưa vi khuẩn có lợi để cạnh tranh và ức chế loài vi khuẩn gây bệnh rất được quan tâm, được cho là giải pháp có nhiều triển vọng phù hợp với điều kiện môi trường, đảm bảo sức khỏe cho con người, cũng như hạn chế được dịch bệnh. Đặc biệt, đưa vi khuẩn Bacillus spp. qua đường tiêu hóa của tôm ngay từ khi mới thả đã hạn chế được mật độ vi khuẩn Vibrio. Nghiên cứu này đã phân lập được các chủng Bacillus subtilis B1, Bacillus subtilis B2, Bacillus amyloliquefaciens B4và thử khả năng đối kháng với vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus V1 ở các nồng độ 103, 104, 105, 106 CFU theo dõi ở các thời điểm 6h, 12h, 24h, 48h và 72h. Kết quả cho thấy cả ba chủng vi khuẩn Bacillus trên phân lập được đều có khả năng ức chế tốt vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus V1, trong đó vi khuẩn Bacillus amyloliquefaciens B4 làtốt nhất với đường kính vòng kháng khuẩn 52,67 ± 4,31mm ở thời điểm 48h; hai chủng Bacillus subtilis B1, Bacillus subtilis B2 lầnlượt là  49,67 ± 3,15 mm, 44,07 ± 5,19 mm, với mức sai số có ý nghĩa thống kê p < 0,05.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document