scholarly journals Secondary respiratory microflora in patients with COVID-19

Author(s):  
Agigat Kadyrova ◽  
◽  
Gulzar Alieva ◽  
Shahla Askerova ◽  
Reikhan Hadjiyeva ◽  
...  

The incidence of secondary lung infections in hospitalized patients with COVID-19 is not well understood. The results of bacteriological research for nonspecific flora of sputum or flushing from the respiratory tract were analyzed for 820 out of 3040 patients with COVID-19 hospitalized at the Research Institute of Lung Diseases in Baku. Secondary respiratory microflora was detected in 771 (94%) patients. in 347 (42.3%) cases, fungi of the genus Candida were found, and in 211 (25.7%) patients this was observed simultaneously with the bacterial microflora. Among bacterial infections, the most common pathogens were Staphylococcus aureus (n109), Klebsiella Pneumoniae (n41), Escherichia Coli (n38), Enterobacter (n33), Streptococcus pneumoniae (n32).

PEDIATRICS ◽  
1988 ◽  
Vol 82 (3) ◽  
pp. 486-491
Author(s):  
Lawrence D. Frenkel ◽  

Ceftriaxone treatment (50 to 80 mg/kg once daily) was given to 201 children between 1 month and 18 years of age. There were 201 serious bacterial infections, including epiglottitis, pneumonia, cellulitis, osteomyelitis, septic arthritis, pyelonephritis, sepsis, and meningitis. The common pathogens responsible for pediatric infections isolated from these patients included Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, and Escherichia coli. The overall clinic cure rate was 94%. Ten patients were clinically improved but not cured. There were two clinical failures. Bacteriologic failure occurred in six patients. The overall bacteriologic cure rate was 97%. Twenty patients (10%) experienced adverse effects; none required discontinuation of therapy. The efficacy, safety, spectrum, and convenience of ceftriaxone monotherapy make this antimicrobial agent a candidate for the treatment of choice of selected serious pediatric infections.


2019 ◽  
pp. 511-521

OBJECTIVES. The use of effective combinated antiretroviral therapy has significantly improved the prognosis of patients with HIV infection. Although current antiretroviral regimens are very effective in inhibiting viral replication, its elimination is not a viable goal of treatment. Despite cART, non–AIDS-defining bacterial infections are still a serious problem. The spectrum of these infections, and in particular the proportion of particular bacterial pathogens, is not sufficiently described in the scientific literature. METHODS. In the study, HIV-infected patients followed at the HIV Out-Patient Clinic in Warsaw were registered in the clinic from 1 January 2007 to 31 July 2016. Survival analysis included 558 patients who met the study criteria. RESULTS. Among 251 (44.9%) of those with positive culture, the most common bacterial pathogen was Staphylococcus aureus (33%) and Escherichia coli (11.1%). The most common bacteria in the upper respiratory tract was Staphylococcus aureus (26.6%). In urine cultures the most common bacteria was Escherichia coli (9.5%). Staphylococcus aureus (2.3%) and Staphylococcus epidermidis (2.3%) were the most common bacterial cultures in the wound. In skin cultures the most common bacteria was Staphylococcus aureus (3.9%). The highest number of positive cultures was obtained from the upper respiratory tract -166 (66.1%). CONCLUSION. Non–AIDS-defining bacterial infections are a common clinical problem in HIV-infected patients despite the introduction of antiretroviral therapy and the pathogens that cause these infections are a very diverse group.


2018 ◽  
Vol 9 (2) ◽  
pp. 98
Author(s):  
Matheus Silva Alves ◽  
Luiz Alfredo Torres Sales ◽  
João Victor Nogueira Nojosa ◽  
Roberval Nascimento Moraes Neto ◽  
Alexsander Rodrigues Carvalho Junior ◽  
...  

As técnicas de biologia molecular são indispensáveis em diversas áreas de pesquisa, dentre elas está a identificação de espécies bacterianas como Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Pseudomona auruginosa, Klebsiella pneumoniae, Corynebacterium diphtheriae, Mycobacterium tuberculosis e Escherichia coli e para isso utilizam primers universais. Este trabalho busca avaliar a qualidade deste primers universais em amplificar e diferenciar as bactérias descritas. Para isso foi utilizado uma PCR in silico e observados os resultados das amplificações. As amplificações demonstraram uma redundância ou mesmo ineficiência de vários dos primers testados. Palavras-chave: Primers; Bacterias; PCR in silico.


2018 ◽  
Vol 69 (4) ◽  
pp. 915-920
Author(s):  
Petronela Cristina Chiriac ◽  
Vladimir Poroch ◽  
Alina Mihaela Pascu ◽  
Mircea Daniel Hogea ◽  
Ileana Antohe ◽  
...  

The antibiotic resistance of microorganisms involved in pediatric infections represents a significant cause of healthcare-associated infections (HAIs), and is also a matter of management, requiring specific intervention. The aim of the study was to evaluate the efficacy of some antibiotic molecules on pathogens isolated from patients admitted in a pediatric hospital. We carried out a descriptive study on a group of 411 patients admitted to the Sf. MariaClinical Emergency Hospital for Children Iasi, between January 1st and March 31st, 2016. Bacterial infections were most prevalent in the age group of 0-1 year (54.98% of the total isolates). Most affected by multidrug-resistant bacterial infections services were: general pediatrics (24.08% of the total isolates), then the intensive care unit (19.95%), surgical wards (14.84%), and acute therapy (11.43%). The germs were isolated from pathological samples: most often pus (23.85%), hypo-pharyngeal aspiration (21.65%), conjunctival secretion (12.42%), and ear secretion (9.48%). Penicillin G and oxacillin were inefficient in 30.26% of the Staphylococcus aureus strains, while erythromycin in 18.42%. Antibiotic resistance of Streptococcus pneumoniae was observed for penicillin G in 7.14% of the strains, while for erythromycin in 13.09%. Klebsiella pneumoniae strains were resistant to amoxicillin + clavulanic acid in 35.85% of the cases, and to cefuroxime, ceftazidime, ceftriaxone, cefepime in 33.96%. Our study highlighted that Staphylococcus aureus was resistant to penicillin G and oxacillin in more than one-third of the isolates, Streptococcus pneumoniae was resistant to penicillin G and erythromycin, and Klebsiella pneumoniae to amoxicillin + clavulanic acid and 1st, 2nd and 3rd generation cephalosporins. Continuing antibioresistance monitoring is crucial in order to promote appropriate guidelines in antibiotic prescription, which could result in decreasing HAIs� rates.


PEDIATRICS ◽  
1981 ◽  
Vol 67 (2) ◽  
pp. 292-295
Author(s):  
Judith B. Allen ◽  
Leonard B. Weiner

Forty episodes of sepsis in 28 patients with leukemia or lymphoma were reviewed. Streptococcus pneumoniae accounted for 14 episodes and was the most frequent etiologic agent isolated. Escherichia coli and Staphylococcus aureus accounted for an additional 16 episodes. No patients with pneumococcal sepsis died whereas the overall mortality was 25%. Five of the patients with pneumococcal sepsis had polymorphonuclear leukocyte counts less than 500/cu mm. All patients in remission who had pneumococcal sepsis had a leukocytosis in response to their infection. Foci in patients with pneumococcal sepsis were identified in 50% of the episodes and all were confined to the respiratory tract.


2021 ◽  
Vol 74 (1) ◽  
pp. 43-48
Author(s):  
А.А. Елеукина ◽  
А.Н Коржумбаев . ◽  
А.Р. Акшалов ◽  
К.Е. Капезов ◽  
Абдихалилов

Внебольничные пневмонии (ВП) представляют серьезную проблему инфекционной патологии человека и являются одной из ведущих причин смерти от инфекционных болезней. По данным ВОЗ, инфекции нижних дыхательных путей занимают 3-е место (после инфаркта и инсульта) в мировой статистике летальных исходов 2011 г. Ведущими возбудителями ВП являются Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, бактерии семейства Enterobacteriaceae – Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli и др., Staphylococcus aureus. К известным атипичным бактериальным возбудителям ВП относятся такие микроорганизмы, как Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Chlamydophila psittaci и Coxiella burnetii. Возбудителями ВП могут быть и респираторные вирусы, наиболее часто – вирусы гриппа, коронавирусы, риносинцитиальный вирус (РС-вирус), метапневмовирус и бокавирус человека. При ВП может иметь место ко-инфекция двумя и более возбудителями, вызванная как ассоциацией различных бактериальных возбудителей, так и их сочетанием с респираторными вирусами. Частота встречаемости ВП, вызванной ассоциацией возбудителей, варьирует от 3 до 40 % Пандемия новой коронавирусной инфекции сопровождается высоким уровнем заболеваемости ВП, с большой долей осложненных и затяжных случаев. Известно, что вирусы вызывают нарушения работы иммунной системы, что делает людей более восприимчивыми к другим патогенам. G. Zahariadis et al. в 2006 г., основываясь на результатах серологических исследований пациентов, перенесших ОРВИ, выявили случаи острой или недавней инфекции C. pneumoniae (30 %) или M. pneumoniae (9 %). Многоцентровое ретроспективное когортное исследование пациентов с тяжелым течением Ближневосточного респираторного синдрома, вызванного коронавирусом (БВРС-КоВ), показало, что 18 и 5 % имели бактериальные и вирусные коинфекции соответственно. Предыдущие исследования показали, что коронавирус наносит серьезный удар по иммунной системе человека. Например, одним из наиболее распространенных симптомов у пациентов с COVID-19 является временное или стойкое снижение уровня лимфоцитов в крови. Разрушение иммунных клеток вирусом SARS-CoV-2 делает пациентов уязвимыми к вторичным бактериальным инфекциям. Пневмония у пациентов с COVID-19 отличается от SARS-CoV-2- негативной внебольничной пневмонии. При тяжѐлом течении COVID-19 несомненна роль в альтерации органов и тканей синдрома активации макрофагов (вторичного гемофагоцитарного лимфогистиоцитоза) и нерегулируемого выброса цитокинов и хемокинов (цитокиновый шторм) с нарушением продукции интерлейкинов, функции Тлимфоцитов, с истощением клеточного иммунного ответа и лимфопенией. Не исключается также развитие вирусиндуцированных аутоиммунных реакций. Системное поражение вирусом и цитокиновым штормом эндотелия (микроангиопатия с его повреждением, реже эндотелиит и васкулит) и активация каскада коагуляции при COVID-19 вызывают гиперкоагуляционный синдром c тромбозами и тромбоэмболиями. Также отмечаются одновременное поражение других органов, которое становится непосредственной причиной смерти, а также сепсис и септический шок при присоединении бактериальной. Одним из ярких маркеров наличия и тяжести воспалительной реакции в организме при COVID-19 является С-реактивный белок (СРБ, CRP – от англ. C-reactive protein). До настоящего времени в большинстве публикаций он рассматривался, в первую очередь, как маркер присоединения бактериальной инфекции, требующей применения антибиотиков, что по уровню СРБ можно было дифференцировать вирусную и бактериальную этиологию пневмонии. Иммунологические исследования показали, что при проникновении вируса SARS-CoV-2 в организм запускается иммунный ответ для борьбы с этим патогеном, что также приводит к повышению уровня СРБ. Концентрация в крови достоверно повышается более популяционно значимого уровня (5 мг/л) уже в течение первых 4–6 ч от момента альтерации, достигая максимума в течение 48 ч (24–72 ч – в зависимости от тяжести патологического процесса). Более того, известно, что она удваивается каждые первые 8 ч, достигая максимума через 36–50 ч, а на фоне тяжелого генерализованного системного воспаления может возрастать в короткое время в 100 и более раз.


2019 ◽  
Vol 17 (3) ◽  
pp. 140-148 ◽  
Author(s):  
A. Ouelhadj ◽  
L. Ait Salem ◽  
D. Djenane

Ce travail vise l’étude de l’activité antibactérienne de l’huile essentielle (HE) de Pelargoniumx asperum et de la bactériocine, la nisine seul et en combinaison vis-à-vis de six bactéries dont quatre sont multirésistantes d’origine clinique. L’activité antibactérienne in vitro a été évaluée par la méthode de diffusion sur gélose. La concentration minimale inhibitrice (CMI) est aussi déterminée pour HE. Les résultats ont révélé une activité antibactérienne significative exercée par HE visà-vis de Staphylococcus aureus (ATCC 43300), Staphylococcus aureus et Escherichia coli avec des diamètres d’inhibition de 36,00 ; 22,50 et 40,00 mm, respectivement. Cependant, l’HE de Pelargonium asperum a montré une activité antibactérienne supérieure par rapport à la nisine. Les valeurs des CMI rapportées dans cette étude sont comprises entre 1,98–3,96 μl/ml. Les combinaisons réalisées entre HE et la nisine ont montré un effet additif vis-à-vis de Escherichia coli (ATCC 25922) avec (50 % HE Pelargonium asperum + 50 % nisine). Par contre, nous avons enregistré une synergie vis-à-vis de Klebsiella pneumoniae avec (75 % HE Pelargonium asperum + 25 % nisine) et contre Pseudomonas aeruginosa avec les trois combinaisons testées. Les résultats obtenus permettent de dire que l’HE de Pelargonium asperum possède une activité antibactérienne ainsi que sa combinaison avec la nisine pourrait représenter une bonne alternative pour la lutte contre l’antibiorésistance.


2020 ◽  
Vol 2 (2) ◽  
pp. 61-68
Author(s):  
Agnina Listya Anggraini ◽  
Ratih Dewi Dwiyanti ◽  
Anny Thuraidah

Infection is a disease caused by the presence of pathogenic microbes, including Staphylococcus aureus and Escherichia coli. Garlic (Allium sativum L.) has chemical contents such as allicin, alkaloids, flavonoids, saponins, tannins, and steroids, which can function as an antibacterial against Staphylococcus aureus and Escherichia coli. This study aims to determine the antibacterial properties of garlic extract powder against Staphylococcus aureus and Escherichia coli. This research is the initial stage of the development of herbal medicines to treat Staphylococcus aureus and Escherichia coli infections. The antibacterial activity test was carried out by the liquid dilution method. The concentrations used were 30 mg/mL, 40 mg/mL, 50 mg/mL, 60 mg/mL and 70 mg/mL. The results showed that the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) against Staphylococcus aureus and Escherichia coli was 40 mg/mL and 50 mg / mL. Minimum Bactericidal Concentration (MBC) results for Staphylococcus aureus and Escherichia coli are 50 mg/mL and 70 mg/mL. Based on the Simple Linear Regression test, the R2 value of Staphylococcus aureus and Escherichia coli is 0.545 and 0.785, so it can be concluded that there is an effect of garlic extract powder on the growth of Staphylococcus aureus and Escherichia coli by 54.5% and 78.5%. Garlic (Allium sativum L.) extract powder has potential as herbal medicine against bacterial infections but requires further research to determine its effect in vivo.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document