Jurnal Biotek Medisiana Indonesia
Latest Publications


TOTAL DOCUMENTS

28
(FIVE YEARS 16)

H-INDEX

1
(FIVE YEARS 0)

Published By Badan Penelitian Dan Pengembangan Kesehatan

2354-8800, 2301-5810

2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 47-54
Author(s):  
Liah Kodariah ◽  
Aziz Ansori Wahid

AbstrakHiperlipidemia merupakan salah satu penyebab penyakit jantung koroner yang ditandai dengan adanya penumpukan lemak yang disebabkan oleh kadar trigliserida tinggi. Hiperlipidemia dapat mengakibatkan perlemakan hati (fatty-liver) sehingga hepatosit mengalami kerusakan dan peningkatan aktivitas enzim trans-aminase. Hati memiliki peran penting untuk metabolisme lipid karena lipid diangkut di dalam darah sebagai lipoprotein yang dibentuk di dalam hati. Tujuan penelitian ini adalah untuk mempelajari pengaruh ekstrak biji ketumbar terhadap kadar trigliserida serum darah dan gambaran histologi hati tikus putih yang diinduksi pakan tinggi lemak. Penelitian menggunakan metode eksperimen, sampel sebanyak 24 ekor tikus putih galur Wistar dikelompokkan kedalam 6 kelompok, yaitu: K1 (tikus diberi pakan normal dan diberi akuades), K2 (tikus hanya diberi pakan tinggi lemak), K3 (tikus diberi pakan tinggi lemak dan simvastatin dosis 0,18 mg/kg BB/hari), K4, K5, dan K6 (tikus diberi pakan diet tinggi lemak dan diberikan ekstrak biji ketumbar dengan dosis masing-masing 5,4 mg/kg BB/hari, 10,8 mg/kg BB/hari, dan 21,6 mg/kg BB/hari). Hasil penelitian menunjukkan adanya penurunan kadar trigliserida serum darah tikus sebelum dan setelah diberikan ekstrak biji ketumbar. Pada gambaran histologi K1, K3, K4, K5, dan K6 didapatkan gambaran histologi hati yang normal, sedangkan pada K2 ditemukan sel kariolisis (nekrosis). Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa ekstrak biji ketumbar berpengaruh terhadap penurunan kadar trigliserida serum darah tikus dan adanya perubahan histologi hati pada kelompok tikus yang diberikan ekstrak biji ketumbar dengan kelompok yang tidak diterapi.Kata kunci: biji ketumbar, trigliserida, histologi, hati, hiperlipidemia.AbstractHyperlipidemia is one of the causes of coronary heart disease marked by the accumulation of fat caused by high triglyceride levels. Hyperlipidemia can cause fatty liver so that hepatocytes experience damage and increase the activity of the transaminase enzyme. The liver has an important role in lipid metabolism because lipids are transported in the blood as lipoproteins formed in the liver. The purpose of this study is to investigate the effect of coriander seed extract on blood serum triglyceride levels and the histological picture of white rat liver induced by high-fat feed. The study used an experimental method in which a sample of 24 white rats were grouped into 6 groups, K1 (rats were given normal feed and given aqua dest), K2 (rats were only given high-fat feed), K3 (rats were given high-fat feed and simvastatin dose 0. 18 mg/kg/day), while K4, K5, and K6 (rats were fed a diet high in fat and given coriander seed extract at a dose of 5.4 mg/kg/day, 10.8 mg/kg/day, and 21.6 mg/kg/day respectively). The results showed a decrease in rat serum triglyceride level before and after coriander seed extract was given. In the histological features of K1, K3, K4, K5, and K6, a normal histological picture of the liver was found, while karyolysis cells (necrosis) were observed in K2 group. Based on the results of the study, the coriander seed extract might affect the reduction in rat serum triglyceride level as well as the histological changes of liver in rats treated with coriander seed extract as compared to the untreated group.Keywords: coriander seed, triglyceride, histology, liver, hyperlipidemia


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 67-80
Author(s):  
Umiatin Umiatin ◽  
Jeanne A Diwinata Pawitan

Abstrak Osteoarthritis (OA) merupakan penyakit sendi dengan prevalensi paling tinggi yang menyebabkan nyeri kronis dan disabilitas. Berbagai faktor antara lain faktor mekanik, biokimia dan faktor enzimatik berperan dalam perkembangan OA. Perkembangan OA dicirikan oleh degradasi berlebihan pada agrekan dalam matriks ekstraseluler tulang rawan sendi. Agrekan berfungsi menyediakan fleksibilitas, viskoelastisitas dan kompresibilitas jaringan. Struktur agrekan tidak konstan sepanjang hidup, namun mengalami perubahan yang disebabkan oleh aktivitas sintesis maupun degradasi. Degradasi agrekan merupakan penanda awal kerusakan tulang rawan sendi pada OA, yang diikuti oleh kerusakan kolagen tipe II. Sejauh ini mekanisme molekulernya belum diketahui pasti, sehingga diperlukan penelitian lebih lanjut mengenai mekanisme dan penyebab kerusakan agrekan. Tulisan ini merupakan suatu kajian naratif berdasarkan artikel dari jurnal nasional dan internasional yang bertujuan untuk memberikan informasi mengenai agrekan meliputi struktur, fungsi, dan faktor-faktor yang berperan pada perubahan struktur agrekan yang menginduksi terjadinya OA. Hasil kajian menunjukkan bahwa perubahan struktur agrekan erat kaitannya dengan perubahan fungsi mekanik tulang rawan sendi. Perubahan ini terjadi terutama karena degradasi yang disebabkan oleh aktivitas enzim, dari keluarga matriks metalloprotease (MMP) dan a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motif (ADAMTS). Dari kajian ini disimpulkan bahwa degradasi agrekan karena aktivitas enzim berperan penting dalam perkembangan OA, sehingga perlu dilakukan penelitian untuk mencari inhibitor enzim MMP dan ADAMTS sebagai agen terapeutik untuk menghambat perkembangan dan progresivitas OA. Kata kunci: osteoarthritis, matriks ektraseluler, agrekan, degradasi. Abstract Osteoarthritis (OA) is a joint disease with the highest prevalence and a major cause of chronic pain and disability. Many factors such as mechanical, biochemical, and enzymatic factors are involved in OA development. The development of OA is characterized by excessive degradation of aggrecan in the extracellular matrix of articular cartilage, which functions to provide flexibility, viscoelasticity, and tissue compressibility. The structure of aggrecan is not constant throughout life but undergoes changes caused by synthesis and degradation activities. Aggrecan degradation is an early marker of joint cartilage damage in OA, followed by type II collagen damage. However, the molecular mechanisms are not completely understood, so further research is needed on the mechanisms and causes of aggrecan damage. Here we provide a narrative review based on articles from national and international journals to describe the structure, function, and factors that contribute to the degradation of aggrecan. The results of the study show that changes in the structure of aggrecan are closely related to changes in the mechanical function of joint cartilage. This change occurs mainly due to degradation caused by enzyme activity, a family of matrix metalloproteinase (MMP) and a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motif (ADAMTS). The present study concludes that aggrecan degradation caused by enzyme activity was very crucial in the development of OA, it was needed to find MMP and ADAMTS inhibitors as a therapeutic agent to prevent the development and progression of OA. Keywords: osteoarthritis, extracellular matrix, aggrecan, degradation


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 67-80
Author(s):  
Rita Noviana ◽  
Muhammad In‟am Ilmiawan ◽  
Mitra Handini

Abstrak Cisplatin (CP) merupakan agen kemoterapi yang banyak digunakan dan menyebabkan nefrotoksisitas. Minyak jintan hitam (MJH) dan madu (M) diketahui memiliki efek nefroprotektif. Tujuan: Mengetahui efek dan sinergitas kombinasi MJH dan madu pada kadar malondialdehid (MDA) ginjal tikus yang diberi pajanan CP. Metode: Penelitian ini menggunakan 30 ekor tikus jantan yang dibagi menjadi 10 kelompok: Kontrol Normal (KN) (diet ad libitum), MJH1 (1 mL/kgBB MJH), MJH2 (2 mL/kgBB MJH), M1 (3,7 mL/kgBB M), M2 (7,4 mL/kgBB M), MJH1-M1 (1 mL/kgBB MJH dan 3,7 mL/kgBB M), MJH1-M2 (1 mL/kgBB MJH dan 7,4 mL/kgBB M), MJH2-M1 (2 mL/kgBB MJH dan 3,7 mL/kgBB M), MJH2-M2 (2 mL/kgBB MJH dan 7,4 mL/kgBB M), dan CP (diet ad libitum). MJH dan madu diberikan secara oral selama 21 hari. Pada hari ke-18, KN diberikan NaCl 0,9% 1 ml/kgBB sedangkan sisanya diberikan CP dosis tunggal 8 mg/kgBB secara intraperitoneal. Kadar MDA ginjal diukur menggunakan metode thiobarbituric acid reactive substances (TBARS). Didapatkan kadar MDA ginjal yang lebih rendah pada semua kelompok dosis tunggal dan kombinasi dibandingkan dengan kelompok CP (p=0,000). Semua kelompok dosis kombinasi memiliki indeks kombinasi <1. Kombinasi MJH dan madu memberikan efek protektif sinergis terhadap kerusakan oksidatif jaringan ginjal tikus akibat pajanan CP. Kata kunci: Minyak jintan hitam, madu, indeks kombinasi, cisplatin, nefrotoksisitas Abstract Cisplatin (CP) is a widely used chemotherapeutic agent that induces nephrotoxicity. Nigella sativa oil (NSO) and honey (H) have demonsrated nephroprotective effect. To investigate the effect and synergy of NSO and honey combination on kidney malondialdehyde (MDA) levels in CP-induced rats. Thirty male rats were divided into ten groups: Normal Control (NC), NSO1, NSO2, H1, H2, NSO1-H1, NSO1-H2, NSO2-H1, NSO2-H2, and CP-treated group which received ad libitum diet, 1 mL/kgbwt. NSO, 2 mL/ kgbwt. NSO, 3.7 mL/kgbwt. H, 7.4 mL/kgbwt. H, 1 mL/kgbwt. NSO and 3.7 mL/kgbwt. H, 1 mL/kgbwt. NSO and 7.4 mL/kgbwt. H, 2 mL/kgbwt. NSO and 3.7 mL/kgbwt. H, 2 mL/kgbwt. NSO and 7.4 mL/kgbwt. H, ad libitum diet, respectively, for 21 days. On the 18th day, NC group received 1 ml/kgbwt. NaCl 0.9% while the rest received 8 mg/kgbwt. single dose CP intraperitoneally. Kidney MDA levels was measured using thiobarbituric acid reactive substance (TBARS) method. Kidney MDA levels was significantly lower in all single and combination dose treatment groups compared to CP-treated group (p=0,000). Combination index of all combination dose treatment groups is <1. NSO and honey combination provided synergistic protective effect against CP-induced oxidative damage in kidney tissue in rats. Keywords: Nigella sativa oil, honey, combination index, cisplatin, nephrotoxicity


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 19-26
Author(s):  
Tri Retno Yova Meidina ◽  
Ninik Mudjihartini ◽  
Dwirini Retno Gunarti ◽  
Yulhasri Yulhasri ◽  
Syarifah Dewi ◽  
...  

Abstrak Batu empedu merupakan penyakit yang banyak ditemukan di Indonesia. Analisis komposisi batu empedu penting untuk mengetahui penyebab, dasar metabolisme pembentukannya, faktor risiko, serta untuk edukasi diet terhadap pasien. Komposisi batu empedu tersebut dapat dipengaruhi oleh berbagai faktor termasuk usia dan jenis kelamin. Sampai saat ini belum terdapat data analisis komposisi dan distribusi batu empedu di Jakarta. Dengan demikian, penelitian ini bertujuan untuk menganalisis komposisi dan distribusi batu empedu yang dihubungkan dengan usia dan jenis kelamin. Penelitian ini merupakan penelitian cross-sectional menggunakan 230 data sekunder hasil analisis komposisi batu empedu di Laboratorium Biokimia dan Biologi Molekuler FKUI dalam periode 3 tahun terakhir (tahun 2017 – 2019). Analisis batu dilakukan dengan uji Salkowski untuk menilai kolesterol serta uji kalsium, karbonat, Fe, pigmen empedu, dan fosfat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa batu empedu sebesar 1,3% merupakan batu murni dan 98,7% merupakan batu campuran. Komposisi terbanyak pada batu campuran yaitu kolesterol (83,91%). Batu empedu paling banyak ditemukan pada perempuan kelompok usia 40—49 tahun (27%). Terdapat hubungan komposisi kolesterol dengan usia (p<0,05) namun tidak terdapat hubungan (p>0,05) dengan jenis kelamin (p>0,05). Kesimpulan dari penelitian ini yaitu kolesterol merupakan penyusun komposisi batu empedu yang terbanyak yang berhubungan dengan usia, namun tidak berhubungan dengan jenis kelamin. Kata kunci: Batu Empedu, Distribusi, Komposisi, Kolesterol Abstract Gallstones are a disease that is commonly found in Indonesian. Analysis of the composition of gallstones is important to determine the etiology, the metabolic basis of its formation, risk factors, and to educate for the patient's diet. The composition of gallstones can be influenced by various factors including age and sex. Until now there is no data analysis of the composition and distribution of gallstones in Jakarta. Thus, this study aims to analyze the composition and distribution of gallstones that are associated with age and sex. This study is a cross-sectional study using 230 secondary data from the analysis of the composition of gallstones in the Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology of FMUI in the last 3 years period (2017 - 2019). Stone analysis was carried out with the Salkowski test to assess cholesterol and also calcium, carbonate, Fe, bile pigment, and phosphate assays. The results showed that 1.3% gallstones were pure stones and 98.7% were mixed stones. The most composition in mixed stones is cholesterol (83.91%). Gallstones are most commonly found in women in the age group of 40-49 years (27%). There is a correlation between cholesterol composition with age (p <0.05) but there is no relationship (p> 0.05) with gender (p> 0.05). This study concluded that cholesterol was the most common constituent of gallstone. Its levels increased with age and did not differ significantly between genders. Keywords: Gallstone, Composition, Distribution, Cholesterol


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 27-34
Author(s):  
Annada Sofia ◽  
Mohamad Sadikin ◽  
Sri Widia Jusman ◽  
Septelia Inawati Wanandi ◽  
Ani Retno Prijanti ◽  
...  

Abstract Cancer prevalence in Indonesia is 1.8 per 1000 population in 2018. Early diagnosis is needed to reduce the mortality rate and one of which is by examining vanillylmandelic acid (VMA) level as tumor markers. VMA is a catecholamine metabolite whose level will increase in several neuroendocrine tumors. This study was conducted to determine the proportion of positive VMA in urine of patients with suspected neuroendocrine tumors in Jakarta and its association with age and gender. This study was a cross-sectional design using secondary data of urinary VMA laboratory examination from 295 patients who suspected neuroendocrine tumors period 2010 to 2019 in Laboratory of Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Medicine Universitas Indonesia. Qualitative examination of urinary VMA used spot test. Positive examination result showed levels of VMA in urine >8mg/24 hours, while negative result showed  8mg/24 hours. Inclusion criteria were subject data with a provisional diagnosis of neuroblastoma, pheochromocytoma, and paraganglioma. The proportion of positive VMA in urine of suspected neuroendocrine tumor patients was 14,2%. There was a significant association between VMA in urine with age (p 0,023), while gender was not significant (p 0,885). In conclusion, there was an association between urinary VMA of suspected neuroendocrine tumor patients with age, however no association with gender.   Keywords: neuroendocrine tumors; urinary vanillylmandelic acid; age; gender     Abstrak Prevalensi kanker di Indonesia pada 2018 adalah 1,8 per 1000 penduduk. Diagnosis dini dibutuhkan untuk mengurangi angka mortalitas, salah satunya melalui pemeriksaan penanda tumor berupa vanillylmandelic acid (VMA). VMA termasuk metabolit katekolamin yang meningkat produksinya pada beberapa tumor neuroendokrin. Penelitian dilakukan untuk mengetahui proporsi VMA positif dalam urin pasien dugaan tumor neuroendokrin di Jakarta serta hubungannya dengan usia dan jenis kelamin. Penelitian ini menggunakan desain cross-sectional yang menggunakan data sekunder hasil pemeriksaan laboratorium VMA urin dari 295 pasien dugaan tumor neuroendokrin periode 2010 hingga 2019 di Laboratorium Departemen Biokimia dan Biologi Molekuler, Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Data VMA kualitatif yang diperoleh, diperiksa dengan metode spot test. Hasil positif menunjukkan kadarnya > 8 mg/24 jam, sedangkan hasil negatif menunjukkan kadarnya  8 mg/24 jam. Kriteria inklusi berupa diagnosis sementara neuroblastoma, pheochromocytoma, dan paraganglioma. Proporsi VMA positif dalam urin pasien dugaan tumor neuroendokrin adalah 14,2%. Terdapat hubungan bermakna antara kadar VMA dalam urin dengan usia (p 0,023), sedangkan dengan jenis kelamin menunjukkan hasil yang tidak bermakna (p 0,885). Dengan demikian dapat disimpukan bahwa terdapat hubungan antara VMA urin pasien dugaan tumor neuroendokrin dengan usia, namun tidak terdapat hubungan dengan jenis kelamin.   Kata kunci: tumor neuroendokrin; vanillylmandelic acid urin; usia; jenis kelamin  


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 9-18
Author(s):  
Conny Riana Tjampakasari ◽  
Andi Yasmon ◽  
Agus Sjahrurachman ◽  
Samsuridjal Djauzi

Abstrak Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) merupakan patogen oportunistik yang penting pada pasien dengan gangguan kekebalan menurun khususnya human immunodeficiency virus (HIV). P. jirovecii tersebar dimanamana, menyebar melalui udara, dan menyerang sistem pernapasan atas. P. jirovecii mempunyai beberapa faktor virulensi, antara lain major surface glycoprotein (MSG) yang merupakan antigen yang paling banyak ditemukan di permukaan. Pendekatan biologi molekuler digunakan untuk mempelajari patogen ini karena hingga saat ini kultur belum dapat dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh data genotip yang dapat dimanfaatkan sebagai dasar data demografi dan epidemiologi molekuler P. jirovecii di Indonesia. Dua puluh sampel sputum positif P. jirovecii pada real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) dilakukan karakterisasi terhadap gen mitochondrial large subunit (mtLSU). Virulensi daerah hot spot gen mtLSU dianalisis dengan metode PCR dan sekuensing deoxyribonucleic acid (DNA). Diperoleh 30 strain dengan 7 varian didominasi oleh varian 3 yang bersirkulasi di Jakarta. Analisis filogenetik dengan strain negara lain menunjukkan strain Jakarta berkerabat dekat dengan strain Iran, India dan Korea. Kata kunci : Pneumocystis jirovecii, mtLSU, PCR, filogenetik Abstract Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) is an important opportunistic pathogen in immunocompromised patients especially human immunodeficiency virus (HIV). P. jirovecii is spread everywhere, spread through the air, and attacking the upper respiratory system. P. jirovecii has several virulence factors, including major surface glycoprotein (MSG) which is the most widely found on the surface antigen. The molecular biology approach is used to study this pathogen because until now culture cannot be done. This study aims to obtain genotype data that can be used as a basis for demographic and molecular epidemiological data of P. jirovecii in Indonesia. Twenty P. jirovecii positive sputum samples on real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) were characterized by the mitochondrial large subunit (mtLSU) gene. Virulence of the mtLSU gene hot spot region was analyzed by PCR method and deoxyribonucleic acid (DNA) sequencing. Obtained 30 strains with 7 variants dominated by variant 3 circulating in Jakarta. Phylogenetic analyzed with strains of other countries shows that Jakarta strains are closely related to strains of Iran, India dan Korea. Keywords: Pneumocystis jirovecii, mtLSU, PCR, phylogenetic


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 35-46
Author(s):  
Wahyu Hidayati ◽  
Maharadingga Maharadingga ◽  
Rezza Syahputra

AbstrakMikroba endofit, khususnya kapang endofit, telah banyak dilaporkan memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa-senyawa yang dapat digunakan dalam bidang pengobatan. Salah satu tanaman obat yang dapat dieksplorasi mikroorganisme endofitnya adalah belimbing wuluh (Averrhoa bilimbi Linn.). Penelitian ini dilakukan sebagai penelitian awal untuk mengetahui potensi kapang endofit dari buah belimbing wuluh sebagai penghasil senyawa antidiabetes yang dilakukan dengan mengetahui aktivitas inhibisi terhadap enzim alfa-amilase. Untuk mencapai tujuan tersebut, beberapa tahap dilakukan dalam penelitian ini yang diawali dengan isolasi kapang endofit yang dilakukan dengan menghancurkan buah belimbing wuluh dan menyebarkannya pada medium Potato Dextrose Agar (PDA), dilanjutkan dengan fermentasi pada medium Potato Dextrose Yeast (PDY) dan ekstraksi dengan menggunakan pelarut etil asetat. Tahap akhir dari penelitian ini adalah uji aktivitas antidiabetes melalui uji inhibisi alfa amilase dengan menggunakan substrat lugol dan enzim alfa-amilase yang berasal dari Bacillus sp. Aktivitas penghambatan diketahui dengan melakukan pengukuran pada microplate reader pada panjang gelombang 595 nm. Pada penelitian ini diperoleh hasil bahwa 12 isolat kapang endofit dengan karakteristik morfologi yang berbeda-beda antar isolat memiliki potensi untuk menghasilkan senyawa antidiabetes yang terlihat dari adanya kemampuan menghambat aktivitas enzim alfa amilase dan isolat BW-10 memiliki aktivitas inhibisi paling tinggi diantara isolat lainnya, yaitu sebesar 45,564%. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan isolat BW-10 memiliki kemiripan sekuens sebesar 99% dengan isolat Trametes elegans. Penelitian ini dapat dilanjutkan dengan uji aktivitas antidiabetes terhadap enzim lainnya dan identifikasi senyawa metabolit sekunder yang dihasilkan oleh kapang tersebut.Kata kunci: Alfa amilase, Antidiabetes, Belimbing wuluh (Averrhoa bilimbi), Kapang endofitAbstractEndophytic microbes have been reported to havean important in the production of secondary metabolites by the host plants. Moreover, some researches reported that these microbes, specifically endophytic fungi, are also able to produce metabolites to cure diseases, such as metabolic syndrme diseases. This study was conducted as a preliminary research to explore the potency of endophytic fungi isolated from fruits of Averrhoa bilimbi Linn. As an alternative resource for antidiabetes compounds production. Here, we screened the antidiabetes activity by analyzing the alfa amylase inhibition activity. Several steps were performed in this research, which started by isolating endophytic fungi from sterilized fresh fruits, fermentation and extraction, and anti-diabetes activity analysis through alpha-amylase inhibition assay as the final step. In this study, we obtained 12 endophytic fungi isolates with different morphological characteristics between isolates have the potential to produce antidiabetic compounds that are seen from the ability to inhibit the activity of the alpha amylase enzyme. The most potential isolate was BW-10 isolate which had the highest inhibitory activity among other isolates, which is 45.564%. Molecular identification results showed isolate BW-10 has a similarity sequence of 99% with Trametes elegans isolate. Antidiabetics activity through various in vitro and in vivo evaluation and secondary metabolites identification are possible to be conducted as further research.Keywords: Alpha-amylase, Antidiabetics, Averrhoa bilimbi, Endophytic fungi


2020 ◽  
Vol 9 (1) ◽  
pp. 1-7
Author(s):  
Wahyu Agung Pratama ◽  
Andriansjah Rukmana ◽  
Fithriyah Sjatha

Abstrak Protein Resuscitation promoting factor–D (Rpf-D) merupakan protein transmembran dari Mycobacterium tuberculosis dan dieskpresikan pada fase reaktivasi infeksi laten menjadi aktif. Protein Rpf-D tersusun atas 154 asam amino berukuran 16 kDa yang dikode oleh 456 basa dari famili gen-Rpf. Pada studi sebelumnya, kami telah berhasil mengklona gen rpfD dari Mycobacterium tuberculosis strain Beijing kedalam plasmid pcDNA3.1, dikenal sebagai pcDNA3.1-rpfD. Dalam studi ini, kami mentransfeksi sel mamalia CHO-K1 dengan plasmid rekombinan pcDNA3.1-rpfD dan dilanjutkan dengan pewarnaan imunologis menggunakan serum mencit yang telah diimunisasi dengan pcDNA3.1-rpfD sebagai vaksin DNA. Hasil pewarnaan menunjukkan bahwa protein RpfD mampu diekspresikan pada sel mamalia. Selain itu, protein rekombinan yang diekspresikan ini terbukti bersifat imunogenik dan mampu menginduksi respon imun humoral pada hewan uji mencit Balb/C berupa IgG1, IgG2a, IgG2b dan IgG3. Hasil penelitian ini menunjukan potensi pemanfaatan protein rekombinan RpfD untuk penelitian lanjutan pengembangan vaksin ataupun uji diagnosis tuberkulosis. Kata kunci: Resuscitation promoting factor-D, Mycobacterium tuberculosis, sel CHO-K1, transfeksi, immunostaining Abstract Resuscitation promoting factor-D (Rpf-D) protein is known as a component of Mycobacterium tuberculosis cell wall which highly expressed in reactivation state of latent tuberculosis to turn in to an active infection. Rpf-D protein is a small protein consist of 154 amino acids encoded by 465 nucleotides in Rpf-gene family and having 16 kDa in size. In our previous study, we had successfully cloned Rpf-D gene of Mycobacterium tuberculosis Beijing strain into pcDNA3.1 plasmid expression system, which named as pcDNA3.1-rpfD later on. In this study, we transfect pcDNA3.1-rpfD into CHO-K1 mammalian cell line followed by immunostaining using mice sera immunized with pcDNA3.1-rpfD as DNA vaccine. Our result shows that our recombinant pcDNA3.1-rpfD construct can express recombinant RpfD protein in mammalian cells. On the other hand, this expressed recombinant protein has been proven to be immunogenic and able to induce a humoral immune response in Balb/C mice especially IgG1, IgG2a, IgG2b, and IgG3. Our study has shown the potency of recombinant RpfD protein which can be further developed as vaccine or diagnostic approach for tuberculosis. Keywords: Resuscitation promoting factor-D, Mycobacterium tuberculosis, CHO-K1 cells, transfection, immunostaining


2019 ◽  
Vol 8 (1) ◽  
pp. 67-75
Author(s):  
Srilaning Driyah ◽  
Lisyani BS ◽  
Kusmiyati DK

Abstract Blood glucose level could be measured before 2-3 months using glycated haemoglobin (HbA1c). In diabetes mellitus (DM) the size of low-density lipoprotein (LDL-K) often changes to a small size, called small dense LDL-K sdLDL) which is atherogenic and low high-density lipoprotein (HDL) level. High HbA1c indicates uncontrolled glucose levels and often cause complications of coronary heart disease (CHD). This is a further investigation from the previous one about ”The Relationship between HbA1c with LDL and Apo B in DM patients with cardiac complications." This study used analytical, cross-sectional design. Thirty patients DM with CHD complications were examined for HbA1C levels via the Exchange-HPLC ion methods, HDL-K and LDL-K by enzymatic colourimetric methods and apo B by the immunoturbidimetry methods. The relationship between variables was analyzed by the Pearson correlation test.The mean level of HbA1c was 8.72%, male HDL was 35.67 mg / dl, female was 39.57 mg / dl, LDL-K was 110.64 mg / dl, apo B was 111.88 mg / dl and sd-LDL was 1, 02. A strong negative relationship between HbA1c and HDL levels for both men and women with r = - 0.647; r = - 0.675 with significance level p = 0.017; p = 0.008. Whereas HbA1c with sd-LDL has a weak negative relationship, but not significant (r = -0.352; p = 0.057). Hence, lipid profile measurement can be considered to monitor risk of cardiovacular diseases, particularly in those with abnormal blood glucose metabolism. AbstrakPemantauan kadar gula 2-3 bulan sebelumnya dapat diukur menggunakan glycated hemoglobin (HbA1c). Pada diabetes melitus (DM) ukuran low density lipoprotein (LDL-K) sering berubah menjadi kecil, yang dinamakan small dence LDL-K (sd-LDL) yang bersifat aterogenik, dan kadar high density lipoprotein (HDL) sering rendah. HbA1c yang tinggi menandakan kadar glukosa tidak terkontrol dan sering menyebabkan salah satu komplikasi ke penyakit jantung koroner (PJK). Penelitian ini merupakan penelitian lanjutan dari penelitian berjudul “ Hubungan HbA1c dengan trigliserida dan Apo B pada penderita DM dengan komplikasi penyakit jantung” Studi ini menggunakan desain analitik potong lintang. Tiga puluh pasien DM dengan komplikasi PJK diperiksa kadar HbA1c melalui metoda ion-Exchange HPLC, HDL-K dan LDL-K dengan metoda kolometrik enzimatik dan apo B dengan metoda imunoturbidimetri. Hubungan antar variabel dianalisis dengan uji korelasi Pearson.Hasil penelitian didapatkan laki laki 16 dan perempuan 14 pasien. Kadar rerata HbA1c 8,72%, HDL laki laki 35,67 mg/dl, perempuan 39,57 mg/dl, LDL-K 110,64 mg/dl, apo B 111,88 mg/dl dan sd-LDL 1,02. Hubungan negatif kuat antara kadar HbA1c dan HDL baik laki laki maupun perempuan dengan r = - 0,647 ; r = - 0,675 dengan tingkat kemaknaan p = 0,017; p = 0,008. Sedangkan HbA1c dengan sd-LDL terdapat hubungan negatif lemah, tetapi tidak bermakna (r=-0,352 ; p = 0,057). Karena itu, pemeriksaan profil lipid dapat dipertimbangkan untuk memantau risiko penyakit kardiovaskular khususnya bagi mereka dengan gangguan metabolisme gula darah


2019 ◽  
Vol 8 (1) ◽  
pp. 9-22
Author(s):  
Siti Munawaroh ◽  
Dian Laila Purwaningroom ◽  
Dianita Rifqia Putri ◽  
Cholik Harun Rosjidi

AbstractBlood pressure regulation is basically control of amount of blood flow to certain tissues according to their metabolic needs. The complexity of the mechanisms involved leading to the assumption that there are many functional and structural proteins involved in blood pressure regulation. Indonesian people, especially those living on the island of Java, usually consume star fruit Averrhoa carambola to reduce blood pressure, but the content of bioactive compounds and the mechanism of their interference with proteins is still unknown. This study aimed to determine the bioactive compound content of Averrhoa carambola's methanol extract and its mechanism of interference with the target proteins. An amount of 200 g Averrhoa carambola dried simplicia was extracted by the maceration method using absolute methanol. The extract was then subjected to phytochemical tests using the Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) method. Based on the results obtained from the GC-MS phytochemical test, the names of the bioactive compounds found in the Averrhoa carambola methanol extract were obtained. The compounds are then analyzed for their target protein in the human body using the STITCH database (http://stitch.embl.de/). The proteins that had been predicted to be the target of active compounds of Averrhoa carambola methanol extract were analyzed for interactions between proteins using the STRINGdb database (https://string-db.org/cgi/input.pl). Based on this research, it can be concluded that Averrhoa carambola fruit methanol extract can help lower blood pressure by producing NO and acting as antioxidants. However, further research (in-vitro and in-vivo) needs to be done to prove the mechanism. AbstrakRegulasi tekanan darah adalah jumlah kontrol aliran darah ke jaringan tertentu sesuai dengan kebutuhan metabolismenya. Kompleksnya mekanisme yang terlibat, memunculkan asumsi terdapat banyak protein fungsional maupun struktural yang terlibat dalam regulasi tekanan darah. Masyarakat Indonesia, terutama yang tinggal di pulau Jawa biasa mengkonsumsi buah belimbing untuk menurunkan tekanan darah, namun kandungan senyawa bioaktif dan mekanisme intervensinya terhadap protein-protein belum diketahui. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kandungan senyawa bioaktif ekstrak metanol buah Averrhoa carambola dan mekanisme intervensinya terhadap protein-protein targetnya. Simplisia kering buah Averrhoa carambola sebanyak 200 g diekstraksi dengan metode maserasi menggunakan metanol absolut. Dari ekstrak tersebut dilakukan uji fitokimia dengan metode Gas chromatography–mass spectrometry (GC-MS) sehingga didapatkan nama-nama senyawa bioaktif yang terdapat pada ekstrak metanol Averrhoa carambola. Senyawa-senyawa tersebut kemudian dianalisis protein targetnya dalam tubuh manusia menggunakan database STITCH (http://stitch.embl.de/). Kemudian dianalisis interaksi antar protein menggunakan database STRINGdb (https://string-db.org/cgi/input.pl). Berdasarkan penelitian ini, ekstrak metanol buah Averrhoa carambola dapat membantu menurunkan tekanan darah dengan memproduksi NO dan berperan sebagai antioksidan. Namun, penelitian lebih lanjut (in-vitro dan in-vivo) perlu dilakukan untuk membuktikan mekanismenya


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document